Protein–RNA interactions for Protein: O88545

Cops6, COP9 signalosome complex subunit 6, mousemouse

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Length 324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops6O88545 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cops6O88545 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cops6O88545 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cops6O88545 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cops6O88545 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cops6O88545 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cops6O88545 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Cops6O88545 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cops6O88545 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cops6O88545 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cops6O88545 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cops6O88545 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cops6O88545 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cops6O88545 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cops6O88545 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Cops6O88545 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cops6O88545 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cops6O88545 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cops6O88545 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cops6O88545 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Cops6O88545 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cops6O88545 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cops6O88545 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cops6O88545 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cops6O88545 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cops6O88545 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cops6O88545 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cops6O88545 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cops6O88545 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cops6O88545 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cops6O88545 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cops6O88545 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cops6O88545 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cops6O88545 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cops6O88545 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cops6O88545 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cops6O88545 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cops6O88545 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cops6O88545 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cops6O88545 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cops6O88545 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cops6O88545 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cops6O88545 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cops6O88545 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cops6O88545 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cops6O88545 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cops6O88545 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Cops6O88545 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cops6O88545 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cops6O88545 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cops6O88545 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cops6O88545 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cops6O88545 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cops6O88545 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cops6O88545 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cops6O88545 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cops6O88545 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cops6O88545 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cops6O88545 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Cops6O88545 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cops6O88545 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cops6O88545 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cops6O88545 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cops6O88545 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cops6O88545 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cops6O88545 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cops6O88545 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cops6O88545 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cops6O88545 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Cops6O88545 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cops6O88545 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cops6O88545 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cops6O88545 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cops6O88545 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cops6O88545 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cops6O88545 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cops6O88545 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cops6O88545 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Cops6O88545 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Cops6O88545 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cops6O88545 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cops6O88545 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Cops6O88545 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cops6O88545 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cops6O88545 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cops6O88545 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cops6O88545 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cops6O88545 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cops6O88545 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cops6O88545 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cops6O88545 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cops6O88545 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cops6O88545 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cops6O88545 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cops6O88545 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cops6O88545 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cops6O88545 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cops6O88545 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cops6O88545 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cops6O88545 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
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