Protein–RNA interactions for Protein: O88329

Myo1a, Unconventional myosin-Ia, mousemouse

Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo1aO88329 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Myo1aO88329 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Myo1aO88329 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Myo1aO88329 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Myo1aO88329 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Myo1aO88329 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Myo1aO88329 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Myo1aO88329 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Myo1aO88329 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Myo1aO88329 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Myo1aO88329 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Myo1aO88329 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Myo1aO88329 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Myo1aO88329 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Myo1aO88329 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Myo1aO88329 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Myo1aO88329 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Myo1aO88329 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Myo1aO88329 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Myo1aO88329 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Myo1aO88329 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Myo1aO88329 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Myo1aO88329 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Myo1aO88329 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Myo1aO88329 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Myo1aO88329 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Myo1aO88329 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Myo1aO88329 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Myo1aO88329 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Myo1aO88329 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Myo1aO88329 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Myo1aO88329 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Myo1aO88329 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Myo1aO88329 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Myo1aO88329 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Myo1aO88329 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Myo1aO88329 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Myo1aO88329 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Myo1aO88329 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Myo1aO88329 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Myo1aO88329 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Myo1aO88329 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Myo1aO88329 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Myo1aO88329 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Myo1aO88329 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Myo1aO88329 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Myo1aO88329 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Myo1aO88329 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Myo1aO88329 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Myo1aO88329 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Myo1aO88329 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Myo1aO88329 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Myo1aO88329 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Myo1aO88329 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Myo1aO88329 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Myo1aO88329 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Myo1aO88329 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Myo1aO88329 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Myo1aO88329 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Myo1aO88329 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Myo1aO88329 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Myo1aO88329 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Myo1aO88329 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Myo1aO88329 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Myo1aO88329 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Myo1aO88329 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Myo1aO88329 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Myo1aO88329 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Myo1aO88329 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Myo1aO88329 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Myo1aO88329 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Myo1aO88329 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Myo1aO88329 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Myo1aO88329 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Myo1aO88329 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Myo1aO88329 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Myo1aO88329 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Myo1aO88329 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Myo1aO88329 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Myo1aO88329 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Myo1aO88329 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Myo1aO88329 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Myo1aO88329 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Myo1aO88329 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Myo1aO88329 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Myo1aO88329 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Myo1aO88329 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Myo1aO88329 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Myo1aO88329 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Myo1aO88329 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Myo1aO88329 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Myo1aO88329 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Myo1aO88329 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Myo1aO88329 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Myo1aO88329 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Myo1aO88329 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Myo1aO88329 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Myo1aO88329 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Myo1aO88329 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Myo1aO88329 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
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