Protein–RNA interactions for Protein: O88327

Ctnnal1, Alpha-catulin, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnal1O88327 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ctnnal1O88327 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ctnnal1O88327 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ctnnal1O88327 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ctnnal1O88327 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ctnnal1O88327 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ctnnal1O88327 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ctnnal1O88327 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ctnnal1O88327 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ctnnal1O88327 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ctnnal1O88327 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ctnnal1O88327 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ctnnal1O88327 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ctnnal1O88327 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ctnnal1O88327 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ctnnal1O88327 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ctnnal1O88327 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ctnnal1O88327 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ctnnal1O88327 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ctnnal1O88327 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctnnal1O88327 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctnnal1O88327 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctnnal1O88327 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctnnal1O88327 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctnnal1O88327 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctnnal1O88327 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ctnnal1O88327 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ctnnal1O88327 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ctnnal1O88327 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ctnnal1O88327 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ctnnal1O88327 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ctnnal1O88327 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ctnnal1O88327 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ctnnal1O88327 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ctnnal1O88327 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ctnnal1O88327 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ctnnal1O88327 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ctnnal1O88327 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ctnnal1O88327 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ctnnal1O88327 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ctnnal1O88327 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ctnnal1O88327 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ctnnal1O88327 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ctnnal1O88327 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ctnnal1O88327 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ctnnal1O88327 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ctnnal1O88327 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ctnnal1O88327 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ctnnal1O88327 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ctnnal1O88327 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ctnnal1O88327 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ctnnal1O88327 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ctnnal1O88327 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ctnnal1O88327 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ctnnal1O88327 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ctnnal1O88327 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ctnnal1O88327 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ctnnal1O88327 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ctnnal1O88327 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ctnnal1O88327 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ctnnal1O88327 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ctnnal1O88327 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ctnnal1O88327 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ctnnal1O88327 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ctnnal1O88327 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ctnnal1O88327 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ctnnal1O88327 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ctnnal1O88327 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ctnnal1O88327 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ctnnal1O88327 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ctnnal1O88327 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ctnnal1O88327 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ctnnal1O88327 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ctnnal1O88327 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ctnnal1O88327 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ctnnal1O88327 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ctnnal1O88327 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ctnnal1O88327 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ctnnal1O88327 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ctnnal1O88327 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ctnnal1O88327 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ctnnal1O88327 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ctnnal1O88327 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ctnnal1O88327 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ctnnal1O88327 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ctnnal1O88327 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ctnnal1O88327 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ctnnal1O88327 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ctnnal1O88327 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ctnnal1O88327 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ctnnal1O88327 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ctnnal1O88327 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ctnnal1O88327 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ctnnal1O88327 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ctnnal1O88327 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ctnnal1O88327 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ctnnal1O88327 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ctnnal1O88327 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ctnnal1O88327 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ctnnal1O88327 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms