Protein–RNA interactions for Protein: O70551

Srpk1, SRSF protein kinase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srpk1O70551 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Srpk1O70551 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Srpk1O70551 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Srpk1O70551 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Srpk1O70551 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Srpk1O70551 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Srpk1O70551 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Srpk1O70551 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Srpk1O70551 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Srpk1O70551 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Srpk1O70551 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Srpk1O70551 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Srpk1O70551 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Srpk1O70551 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Srpk1O70551 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Srpk1O70551 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Srpk1O70551 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Srpk1O70551 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Srpk1O70551 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Srpk1O70551 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Srpk1O70551 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Srpk1O70551 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Srpk1O70551 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Srpk1O70551 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Srpk1O70551 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Srpk1O70551 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Srpk1O70551 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Srpk1O70551 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Srpk1O70551 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Srpk1O70551 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Srpk1O70551 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Srpk1O70551 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Srpk1O70551 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Srpk1O70551 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Srpk1O70551 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Srpk1O70551 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Srpk1O70551 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Srpk1O70551 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Srpk1O70551 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Srpk1O70551 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Srpk1O70551 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Srpk1O70551 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Srpk1O70551 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Srpk1O70551 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Srpk1O70551 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Srpk1O70551 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Srpk1O70551 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Srpk1O70551 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Srpk1O70551 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Srpk1O70551 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Srpk1O70551 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Srpk1O70551 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Srpk1O70551 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Srpk1O70551 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Srpk1O70551 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Srpk1O70551 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Srpk1O70551 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Srpk1O70551 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Srpk1O70551 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Srpk1O70551 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Srpk1O70551 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Srpk1O70551 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Srpk1O70551 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Srpk1O70551 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Srpk1O70551 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Srpk1O70551 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Srpk1O70551 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Srpk1O70551 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Srpk1O70551 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Srpk1O70551 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Srpk1O70551 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Srpk1O70551 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Srpk1O70551 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Srpk1O70551 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Srpk1O70551 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Srpk1O70551 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Srpk1O70551 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Srpk1O70551 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Srpk1O70551 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Srpk1O70551 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Srpk1O70551 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Srpk1O70551 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Srpk1O70551 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Srpk1O70551 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Srpk1O70551 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Srpk1O70551 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Srpk1O70551 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Srpk1O70551 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Srpk1O70551 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Srpk1O70551 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Srpk1O70551 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Srpk1O70551 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Srpk1O70551 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Srpk1O70551 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Srpk1O70551 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Srpk1O70551 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Srpk1O70551 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Srpk1O70551 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Srpk1O70551 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Srpk1O70551 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms