Protein–RNA interactions for Protein: O70340

Nptx2, Neuronal pentraxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nptx2O70340 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nptx2O70340 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nptx2O70340 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nptx2O70340 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nptx2O70340 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nptx2O70340 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nptx2O70340 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nptx2O70340 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nptx2O70340 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nptx2O70340 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nptx2O70340 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nptx2O70340 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nptx2O70340 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nptx2O70340 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Nptx2O70340 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nptx2O70340 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nptx2O70340 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nptx2O70340 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nptx2O70340 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nptx2O70340 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nptx2O70340 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nptx2O70340 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Nptx2O70340 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nptx2O70340 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nptx2O70340 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nptx2O70340 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nptx2O70340 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nptx2O70340 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nptx2O70340 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nptx2O70340 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nptx2O70340 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nptx2O70340 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nptx2O70340 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nptx2O70340 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nptx2O70340 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nptx2O70340 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nptx2O70340 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nptx2O70340 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nptx2O70340 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nptx2O70340 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nptx2O70340 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nptx2O70340 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nptx2O70340 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nptx2O70340 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nptx2O70340 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nptx2O70340 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Nptx2O70340 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nptx2O70340 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nptx2O70340 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nptx2O70340 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nptx2O70340 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nptx2O70340 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nptx2O70340 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nptx2O70340 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nptx2O70340 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nptx2O70340 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nptx2O70340 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nptx2O70340 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nptx2O70340 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nptx2O70340 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Nptx2O70340 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nptx2O70340 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nptx2O70340 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nptx2O70340 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nptx2O70340 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nptx2O70340 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nptx2O70340 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nptx2O70340 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nptx2O70340 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nptx2O70340 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nptx2O70340 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nptx2O70340 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nptx2O70340 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nptx2O70340 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nptx2O70340 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nptx2O70340 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Nptx2O70340 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Nptx2O70340 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nptx2O70340 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Nptx2O70340 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nptx2O70340 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nptx2O70340 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nptx2O70340 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nptx2O70340 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nptx2O70340 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nptx2O70340 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nptx2O70340 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nptx2O70340 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Nptx2O70340 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nptx2O70340 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nptx2O70340 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nptx2O70340 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nptx2O70340 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nptx2O70340 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nptx2O70340 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nptx2O70340 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nptx2O70340 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nptx2O70340 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nptx2O70340 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nptx2O70340 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms