Protein–RNA interactions for Protein: O70338

Rnaseh1, Ribonuclease H1, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh1O70338 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnaseh1O70338 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnaseh1O70338 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnaseh1O70338 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rnaseh1O70338 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rnaseh1O70338 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rnaseh1O70338 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rnaseh1O70338 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rnaseh1O70338 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rnaseh1O70338 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rnaseh1O70338 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rnaseh1O70338 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rnaseh1O70338 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rnaseh1O70338 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rnaseh1O70338 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rnaseh1O70338 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rnaseh1O70338 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rnaseh1O70338 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rnaseh1O70338 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rnaseh1O70338 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rnaseh1O70338 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rnaseh1O70338 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rnaseh1O70338 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rnaseh1O70338 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rnaseh1O70338 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rnaseh1O70338 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rnaseh1O70338 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rnaseh1O70338 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rnaseh1O70338 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rnaseh1O70338 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rnaseh1O70338 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rnaseh1O70338 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rnaseh1O70338 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rnaseh1O70338 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rnaseh1O70338 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rnaseh1O70338 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rnaseh1O70338 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rnaseh1O70338 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rnaseh1O70338 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rnaseh1O70338 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rnaseh1O70338 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Rnaseh1O70338 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rnaseh1O70338 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rnaseh1O70338 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rnaseh1O70338 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rnaseh1O70338 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rnaseh1O70338 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rnaseh1O70338 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rnaseh1O70338 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rnaseh1O70338 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rnaseh1O70338 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rnaseh1O70338 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rnaseh1O70338 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rnaseh1O70338 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rnaseh1O70338 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rnaseh1O70338 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rnaseh1O70338 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rnaseh1O70338 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rnaseh1O70338 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rnaseh1O70338 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rnaseh1O70338 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rnaseh1O70338 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rnaseh1O70338 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rnaseh1O70338 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rnaseh1O70338 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rnaseh1O70338 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rnaseh1O70338 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rnaseh1O70338 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnaseh1O70338 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnaseh1O70338 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnaseh1O70338 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnaseh1O70338 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnaseh1O70338 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnaseh1O70338 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnaseh1O70338 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnaseh1O70338 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnaseh1O70338 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnaseh1O70338 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnaseh1O70338 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnaseh1O70338 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnaseh1O70338 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnaseh1O70338 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnaseh1O70338 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnaseh1O70338 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rnaseh1O70338 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rnaseh1O70338 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rnaseh1O70338 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rnaseh1O70338 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rnaseh1O70338 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rnaseh1O70338 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rnaseh1O70338 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnaseh1O70338 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnaseh1O70338 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnaseh1O70338 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnaseh1O70338 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnaseh1O70338 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnaseh1O70338 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnaseh1O70338 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rnaseh1O70338 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rnaseh1O70338 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms