Protein–RNA interactions for Protein: O55135

Eif6, Eukaryotic translation initiation factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif6O55135 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Eif6O55135 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Eif6O55135 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Eif6O55135 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Eif6O55135 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Eif6O55135 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Eif6O55135 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Eif6O55135 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Eif6O55135 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Eif6O55135 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Eif6O55135 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Eif6O55135 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Eif6O55135 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Eif6O55135 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Eif6O55135 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Eif6O55135 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Eif6O55135 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Eif6O55135 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Eif6O55135 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Eif6O55135 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Eif6O55135 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Eif6O55135 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Eif6O55135 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Eif6O55135 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Eif6O55135 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Eif6O55135 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Eif6O55135 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Eif6O55135 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Eif6O55135 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Eif6O55135 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Eif6O55135 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Eif6O55135 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Eif6O55135 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Eif6O55135 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Eif6O55135 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Eif6O55135 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Eif6O55135 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Eif6O55135 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Eif6O55135 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Eif6O55135 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Eif6O55135 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Eif6O55135 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Eif6O55135 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Eif6O55135 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Eif6O55135 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Eif6O55135 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Eif6O55135 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Eif6O55135 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Eif6O55135 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Eif6O55135 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Eif6O55135 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Eif6O55135 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Eif6O55135 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Eif6O55135 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Eif6O55135 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Eif6O55135 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Eif6O55135 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Eif6O55135 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Eif6O55135 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Eif6O55135 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Eif6O55135 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Eif6O55135 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Eif6O55135 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Eif6O55135 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Eif6O55135 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Eif6O55135 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Eif6O55135 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Eif6O55135 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Eif6O55135 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Eif6O55135 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Eif6O55135 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Eif6O55135 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Eif6O55135 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Eif6O55135 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Eif6O55135 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Eif6O55135 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Eif6O55135 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Eif6O55135 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Eif6O55135 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Eif6O55135 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Eif6O55135 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Eif6O55135 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Eif6O55135 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Eif6O55135 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Eif6O55135 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Eif6O55135 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Eif6O55135 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Eif6O55135 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Eif6O55135 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Eif6O55135 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Eif6O55135 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Eif6O55135 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Eif6O55135 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Eif6O55135 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Eif6O55135 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Eif6O55135 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Eif6O55135 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Eif6O55135 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Eif6O55135 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Eif6O55135 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms