Protein–RNA interactions for Protein: O55101

Syngr2, Synaptogyrin-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr2O55101 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syngr2O55101 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syngr2O55101 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syngr2O55101 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syngr2O55101 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syngr2O55101 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syngr2O55101 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syngr2O55101 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syngr2O55101 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syngr2O55101 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syngr2O55101 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syngr2O55101 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syngr2O55101 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syngr2O55101 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syngr2O55101 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syngr2O55101 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syngr2O55101 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syngr2O55101 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syngr2O55101 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syngr2O55101 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syngr2O55101 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syngr2O55101 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syngr2O55101 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Syngr2O55101 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syngr2O55101 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syngr2O55101 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syngr2O55101 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syngr2O55101 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syngr2O55101 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syngr2O55101 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syngr2O55101 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syngr2O55101 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syngr2O55101 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syngr2O55101 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syngr2O55101 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syngr2O55101 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syngr2O55101 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syngr2O55101 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syngr2O55101 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syngr2O55101 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syngr2O55101 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syngr2O55101 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syngr2O55101 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syngr2O55101 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syngr2O55101 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syngr2O55101 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syngr2O55101 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syngr2O55101 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syngr2O55101 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syngr2O55101 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syngr2O55101 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syngr2O55101 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syngr2O55101 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syngr2O55101 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syngr2O55101 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syngr2O55101 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syngr2O55101 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syngr2O55101 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syngr2O55101 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syngr2O55101 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syngr2O55101 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syngr2O55101 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syngr2O55101 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syngr2O55101 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syngr2O55101 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syngr2O55101 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syngr2O55101 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syngr2O55101 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syngr2O55101 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syngr2O55101 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Syngr2O55101 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Syngr2O55101 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Syngr2O55101 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Syngr2O55101 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Syngr2O55101 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Syngr2O55101 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Syngr2O55101 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Syngr2O55101 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syngr2O55101 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syngr2O55101 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syngr2O55101 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Syngr2O55101 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syngr2O55101 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syngr2O55101 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syngr2O55101 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Syngr2O55101 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syngr2O55101 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syngr2O55101 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syngr2O55101 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syngr2O55101 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syngr2O55101 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syngr2O55101 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syngr2O55101 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syngr2O55101 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syngr2O55101 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syngr2O55101 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syngr2O55101 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syngr2O55101 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syngr2O55101 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syngr2O55101 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms