Protein–RNA interactions for Protein: O55033

Nck2, Cytoplasmic protein NCK2, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nck2O55033 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nck2O55033 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Nck2O55033 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nck2O55033 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nck2O55033 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nck2O55033 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nck2O55033 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nck2O55033 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Nck2O55033 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nck2O55033 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Nck2O55033 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nck2O55033 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nck2O55033 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nck2O55033 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nck2O55033 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nck2O55033 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nck2O55033 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nck2O55033 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nck2O55033 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nck2O55033 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nck2O55033 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nck2O55033 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nck2O55033 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nck2O55033 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nck2O55033 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Nck2O55033 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Nck2O55033 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Nck2O55033 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nck2O55033 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nck2O55033 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Nck2O55033 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Nck2O55033 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nck2O55033 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nck2O55033 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nck2O55033 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nck2O55033 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nck2O55033 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nck2O55033 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Nck2O55033 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nck2O55033 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nck2O55033 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nck2O55033 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nck2O55033 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nck2O55033 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nck2O55033 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nck2O55033 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Nck2O55033 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nck2O55033 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nck2O55033 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nck2O55033 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nck2O55033 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nck2O55033 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nck2O55033 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nck2O55033 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nck2O55033 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nck2O55033 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nck2O55033 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nck2O55033 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nck2O55033 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nck2O55033 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nck2O55033 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nck2O55033 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nck2O55033 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nck2O55033 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nck2O55033 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nck2O55033 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nck2O55033 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nck2O55033 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Nck2O55033 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Nck2O55033 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Nck2O55033 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nck2O55033 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Nck2O55033 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nck2O55033 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nck2O55033 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nck2O55033 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nck2O55033 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nck2O55033 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nck2O55033 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nck2O55033 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nck2O55033 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Nck2O55033 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nck2O55033 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nck2O55033 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Nck2O55033 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nck2O55033 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nck2O55033 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nck2O55033 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nck2O55033 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nck2O55033 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nck2O55033 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nck2O55033 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nck2O55033 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nck2O55033 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nck2O55033 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nck2O55033 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nck2O55033 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nck2O55033 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nck2O55033 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nck2O55033 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms