Protein–RNA interactions for Protein: O54851

Gjd2, Gap junction delta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjd2O54851 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gjd2O54851 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Gjd2O54851 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gjd2O54851 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gjd2O54851 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gjd2O54851 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gjd2O54851 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gjd2O54851 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gjd2O54851 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gjd2O54851 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gjd2O54851 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gjd2O54851 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gjd2O54851 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gjd2O54851 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gjd2O54851 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gjd2O54851 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gjd2O54851 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gjd2O54851 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gjd2O54851 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gjd2O54851 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gjd2O54851 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gjd2O54851 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Gjd2O54851 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gjd2O54851 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gjd2O54851 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gjd2O54851 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gjd2O54851 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gjd2O54851 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gjd2O54851 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gjd2O54851 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gjd2O54851 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Gjd2O54851 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Gjd2O54851 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gjd2O54851 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gjd2O54851 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gjd2O54851 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gjd2O54851 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gjd2O54851 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gjd2O54851 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gjd2O54851 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gjd2O54851 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gjd2O54851 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gjd2O54851 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gjd2O54851 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gjd2O54851 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gjd2O54851 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gjd2O54851 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gjd2O54851 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gjd2O54851 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gjd2O54851 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Gjd2O54851 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Gjd2O54851 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gjd2O54851 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gjd2O54851 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gjd2O54851 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gjd2O54851 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gjd2O54851 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gjd2O54851 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gjd2O54851 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gjd2O54851 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gjd2O54851 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gjd2O54851 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Gjd2O54851 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gjd2O54851 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Gjd2O54851 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gjd2O54851 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gjd2O54851 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Gjd2O54851 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gjd2O54851 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gjd2O54851 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gjd2O54851 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gjd2O54851 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gjd2O54851 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gjd2O54851 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gjd2O54851 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gjd2O54851 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gjd2O54851 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gjd2O54851 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gjd2O54851 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gjd2O54851 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gjd2O54851 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gjd2O54851 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gjd2O54851 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gjd2O54851 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Gjd2O54851 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gjd2O54851 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gjd2O54851 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gjd2O54851 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gjd2O54851 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gjd2O54851 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gjd2O54851 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gjd2O54851 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gjd2O54851 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gjd2O54851 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Gjd2O54851 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gjd2O54851 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gjd2O54851 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gjd2O54851 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gjd2O54851 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gjd2O54851 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms