Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
FxnO35943 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
FxnO35943 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
FxnO35943 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FxnO35943 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FxnO35943 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FxnO35943 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FxnO35943 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FxnO35943 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FxnO35943 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FxnO35943 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FxnO35943 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FxnO35943 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FxnO35943 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FxnO35943 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FxnO35943 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FxnO35943 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FxnO35943 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FxnO35943 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FxnO35943 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FxnO35943 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FxnO35943 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FxnO35943 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FxnO35943 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FxnO35943 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FxnO35943 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FxnO35943 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FxnO35943 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FxnO35943 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FxnO35943 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FxnO35943 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FxnO35943 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FxnO35943 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FxnO35943 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FxnO35943 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FxnO35943 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FxnO35943 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FxnO35943 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FxnO35943 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FxnO35943 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FxnO35943 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FxnO35943 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FxnO35943 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FxnO35943 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FxnO35943 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FxnO35943 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FxnO35943 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FxnO35943 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FxnO35943 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FxnO35943 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FxnO35943 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FxnO35943 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
FxnO35943 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FxnO35943 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FxnO35943 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FxnO35943 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FxnO35943 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FxnO35943 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FxnO35943 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FxnO35943 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FxnO35943 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FxnO35943 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FxnO35943 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FxnO35943 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FxnO35943 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FxnO35943 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FxnO35943 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FxnO35943 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FxnO35943 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FxnO35943 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FxnO35943 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FxnO35943 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FxnO35943 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FxnO35943 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FxnO35943 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
FxnO35943 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FxnO35943 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FxnO35943 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FxnO35943 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FxnO35943 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FxnO35943 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FxnO35943 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FxnO35943 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FxnO35943 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
FxnO35943 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FxnO35943 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FxnO35943 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FxnO35943 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FxnO35943 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FxnO35943 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FxnO35943 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FxnO35943 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FxnO35943 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FxnO35943 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FxnO35943 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FxnO35943 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FxnO35943 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FxnO35943 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FxnO35943 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FxnO35943 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms