Protein–RNA interactions for Protein: O35902

Dsg3, Desmoglein-3, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg3O35902 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dsg3O35902 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dsg3O35902 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dsg3O35902 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dsg3O35902 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dsg3O35902 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dsg3O35902 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dsg3O35902 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dsg3O35902 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Dsg3O35902 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dsg3O35902 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Dsg3O35902 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Dsg3O35902 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Dsg3O35902 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dsg3O35902 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dsg3O35902 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dsg3O35902 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dsg3O35902 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dsg3O35902 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dsg3O35902 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dsg3O35902 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dsg3O35902 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dsg3O35902 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dsg3O35902 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dsg3O35902 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dsg3O35902 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dsg3O35902 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dsg3O35902 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dsg3O35902 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dsg3O35902 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dsg3O35902 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dsg3O35902 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dsg3O35902 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dsg3O35902 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dsg3O35902 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dsg3O35902 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dsg3O35902 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dsg3O35902 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dsg3O35902 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dsg3O35902 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dsg3O35902 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Dsg3O35902 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dsg3O35902 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dsg3O35902 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dsg3O35902 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Dsg3O35902 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dsg3O35902 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dsg3O35902 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dsg3O35902 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dsg3O35902 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dsg3O35902 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dsg3O35902 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dsg3O35902 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dsg3O35902 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dsg3O35902 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dsg3O35902 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dsg3O35902 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dsg3O35902 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dsg3O35902 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dsg3O35902 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Dsg3O35902 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dsg3O35902 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dsg3O35902 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dsg3O35902 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dsg3O35902 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dsg3O35902 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dsg3O35902 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dsg3O35902 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dsg3O35902 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dsg3O35902 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dsg3O35902 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dsg3O35902 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dsg3O35902 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dsg3O35902 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dsg3O35902 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Dsg3O35902 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Dsg3O35902 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Dsg3O35902 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dsg3O35902 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dsg3O35902 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dsg3O35902 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Dsg3O35902 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dsg3O35902 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dsg3O35902 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dsg3O35902 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dsg3O35902 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dsg3O35902 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dsg3O35902 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dsg3O35902 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dsg3O35902 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dsg3O35902 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dsg3O35902 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dsg3O35902 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dsg3O35902 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dsg3O35902 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dsg3O35902 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dsg3O35902 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dsg3O35902 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dsg3O35902 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dsg3O35902 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms