Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited2O35740 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cited2O35740 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cited2O35740 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cited2O35740 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cited2O35740 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cited2O35740 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cited2O35740 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cited2O35740 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cited2O35740 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cited2O35740 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cited2O35740 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cited2O35740 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cited2O35740 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cited2O35740 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cited2O35740 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cited2O35740 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cited2O35740 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cited2O35740 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cited2O35740 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cited2O35740 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cited2O35740 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cited2O35740 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cited2O35740 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cited2O35740 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cited2O35740 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cited2O35740 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cited2O35740 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cited2O35740 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cited2O35740 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cited2O35740 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cited2O35740 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cited2O35740 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cited2O35740 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cited2O35740 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cited2O35740 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cited2O35740 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cited2O35740 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cited2O35740 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cited2O35740 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cited2O35740 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cited2O35740 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cited2O35740 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cited2O35740 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cited2O35740 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cited2O35740 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cited2O35740 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cited2O35740 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cited2O35740 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cited2O35740 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cited2O35740 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cited2O35740 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cited2O35740 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cited2O35740 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cited2O35740 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cited2O35740 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cited2O35740 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cited2O35740 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cited2O35740 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cited2O35740 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cited2O35740 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cited2O35740 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cited2O35740 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cited2O35740 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cited2O35740 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cited2O35740 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cited2O35740 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cited2O35740 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cited2O35740 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cited2O35740 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cited2O35740 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cited2O35740 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cited2O35740 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cited2O35740 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cited2O35740 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cited2O35740 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cited2O35740 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cited2O35740 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cited2O35740 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cited2O35740 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cited2O35740 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cited2O35740 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cited2O35740 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cited2O35740 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cited2O35740 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cited2O35740 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cited2O35740 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cited2O35740 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cited2O35740 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cited2O35740 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cited2O35740 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cited2O35740 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cited2O35740 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cited2O35740 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cited2O35740 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cited2O35740 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cited2O35740 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cited2O35740 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cited2O35740 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cited2O35740 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cited2O35740 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms