Protein–RNA interactions for Protein: O35638

Stag2, Cohesin subunit SA-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag2O35638 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Stag2O35638 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Stag2O35638 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Stag2O35638 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Stag2O35638 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Stag2O35638 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Stag2O35638 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Stag2O35638 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Stag2O35638 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Stag2O35638 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Stag2O35638 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Stag2O35638 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Stag2O35638 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Stag2O35638 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Stag2O35638 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Stag2O35638 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Stag2O35638 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Stag2O35638 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Stag2O35638 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Stag2O35638 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Stag2O35638 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Stag2O35638 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Stag2O35638 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Stag2O35638 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Stag2O35638 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Stag2O35638 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Stag2O35638 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Stag2O35638 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Stag2O35638 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Stag2O35638 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Stag2O35638 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Stag2O35638 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Stag2O35638 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Stag2O35638 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Stag2O35638 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Stag2O35638 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Stag2O35638 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Stag2O35638 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Stag2O35638 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Stag2O35638 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Stag2O35638 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Stag2O35638 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Stag2O35638 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Stag2O35638 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Stag2O35638 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Stag2O35638 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Stag2O35638 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Stag2O35638 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Stag2O35638 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Stag2O35638 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Stag2O35638 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Stag2O35638 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Stag2O35638 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Stag2O35638 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Stag2O35638 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Stag2O35638 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Stag2O35638 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Stag2O35638 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Stag2O35638 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Stag2O35638 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Stag2O35638 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Stag2O35638 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Stag2O35638 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Stag2O35638 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Stag2O35638 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Stag2O35638 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Stag2O35638 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Stag2O35638 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Stag2O35638 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Stag2O35638 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Stag2O35638 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Stag2O35638 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Stag2O35638 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Stag2O35638 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Stag2O35638 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Stag2O35638 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Stag2O35638 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Stag2O35638 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Stag2O35638 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Stag2O35638 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Stag2O35638 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Stag2O35638 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Stag2O35638 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Stag2O35638 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Stag2O35638 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Stag2O35638 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Stag2O35638 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Stag2O35638 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Stag2O35638 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Stag2O35638 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Stag2O35638 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Stag2O35638 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Stag2O35638 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Stag2O35638 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Stag2O35638 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Stag2O35638 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Stag2O35638 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Stag2O35638 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Stag2O35638 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Stag2O35638 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms