Protein–RNA interactions for Protein: O35526

Stx1a, Syntaxin-1A, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx1aO35526 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Stx1aO35526 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Stx1aO35526 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Stx1aO35526 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Stx1aO35526 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Stx1aO35526 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Stx1aO35526 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Stx1aO35526 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Stx1aO35526 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Stx1aO35526 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Stx1aO35526 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Stx1aO35526 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Stx1aO35526 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Stx1aO35526 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Stx1aO35526 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Stx1aO35526 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Stx1aO35526 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Stx1aO35526 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Stx1aO35526 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Stx1aO35526 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Stx1aO35526 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Stx1aO35526 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Stx1aO35526 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Stx1aO35526 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Stx1aO35526 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Stx1aO35526 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Stx1aO35526 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Stx1aO35526 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Stx1aO35526 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Stx1aO35526 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Stx1aO35526 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Stx1aO35526 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Stx1aO35526 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Stx1aO35526 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Stx1aO35526 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Stx1aO35526 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Stx1aO35526 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Stx1aO35526 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Stx1aO35526 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Stx1aO35526 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Stx1aO35526 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Stx1aO35526 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Stx1aO35526 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Stx1aO35526 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Stx1aO35526 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Stx1aO35526 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Stx1aO35526 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Stx1aO35526 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Stx1aO35526 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Stx1aO35526 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Stx1aO35526 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Stx1aO35526 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Stx1aO35526 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Stx1aO35526 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Stx1aO35526 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Stx1aO35526 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Stx1aO35526 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Stx1aO35526 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Stx1aO35526 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Stx1aO35526 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Stx1aO35526 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Stx1aO35526 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Stx1aO35526 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Stx1aO35526 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Stx1aO35526 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Stx1aO35526 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Stx1aO35526 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Stx1aO35526 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Stx1aO35526 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Stx1aO35526 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Stx1aO35526 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Stx1aO35526 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Stx1aO35526 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Stx1aO35526 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Stx1aO35526 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Stx1aO35526 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Stx1aO35526 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Stx1aO35526 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Stx1aO35526 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Stx1aO35526 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Stx1aO35526 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Stx1aO35526 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Stx1aO35526 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Stx1aO35526 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Stx1aO35526 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Stx1aO35526 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Stx1aO35526 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Stx1aO35526 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Stx1aO35526 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Stx1aO35526 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Stx1aO35526 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Stx1aO35526 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Stx1aO35526 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Stx1aO35526 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Stx1aO35526 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Stx1aO35526 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Stx1aO35526 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Stx1aO35526 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Stx1aO35526 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Stx1aO35526 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms