Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cldn4O35054 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Cldn4O35054 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cldn4O35054 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cldn4O35054 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cldn4O35054 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cldn4O35054 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cldn4O35054 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cldn4O35054 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cldn4O35054 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cldn4O35054 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cldn4O35054 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cldn4O35054 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Cldn4O35054 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cldn4O35054 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cldn4O35054 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cldn4O35054 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cldn4O35054 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cldn4O35054 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cldn4O35054 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cldn4O35054 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cldn4O35054 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cldn4O35054 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cldn4O35054 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Cldn4O35054 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Cldn4O35054 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cldn4O35054 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cldn4O35054 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cldn4O35054 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cldn4O35054 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cldn4O35054 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cldn4O35054 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cldn4O35054 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cldn4O35054 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cldn4O35054 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cldn4O35054 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cldn4O35054 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cldn4O35054 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Cldn4O35054 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cldn4O35054 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cldn4O35054 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cldn4O35054 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cldn4O35054 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Cldn4O35054 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cldn4O35054 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cldn4O35054 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Cldn4O35054 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cldn4O35054 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cldn4O35054 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cldn4O35054 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cldn4O35054 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cldn4O35054 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cldn4O35054 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Cldn4O35054 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Cldn4O35054 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Cldn4O35054 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cldn4O35054 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cldn4O35054 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cldn4O35054 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Cldn4O35054 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cldn4O35054 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cldn4O35054 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cldn4O35054 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cldn4O35054 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cldn4O35054 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cldn4O35054 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cldn4O35054 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cldn4O35054 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cldn4O35054 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cldn4O35054 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cldn4O35054 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cldn4O35054 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cldn4O35054 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cldn4O35054 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cldn4O35054 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cldn4O35054 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cldn4O35054 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cldn4O35054 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cldn4O35054 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cldn4O35054 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Cldn4O35054 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cldn4O35054 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cldn4O35054 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Cldn4O35054 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cldn4O35054 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cldn4O35054 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cldn4O35054 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cldn4O35054 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cldn4O35054 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cldn4O35054 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cldn4O35054 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cldn4O35054 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cldn4O35054 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cldn4O35054 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Cldn4O35054 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cldn4O35054 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cldn4O35054 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cldn4O35054 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cldn4O35054 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cldn4O35054 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms