Protein–RNA interactions for Protein: O09126

Sema4d, Semaphorin-4D, mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4dO09126 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sema4dO09126 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sema4dO09126 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sema4dO09126 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sema4dO09126 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sema4dO09126 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sema4dO09126 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sema4dO09126 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sema4dO09126 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sema4dO09126 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sema4dO09126 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sema4dO09126 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sema4dO09126 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sema4dO09126 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sema4dO09126 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Sema4dO09126 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sema4dO09126 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sema4dO09126 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sema4dO09126 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Sema4dO09126 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sema4dO09126 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sema4dO09126 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sema4dO09126 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sema4dO09126 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sema4dO09126 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sema4dO09126 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sema4dO09126 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sema4dO09126 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sema4dO09126 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sema4dO09126 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sema4dO09126 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sema4dO09126 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sema4dO09126 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sema4dO09126 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sema4dO09126 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Sema4dO09126 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sema4dO09126 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sema4dO09126 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Sema4dO09126 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sema4dO09126 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sema4dO09126 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sema4dO09126 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sema4dO09126 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sema4dO09126 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sema4dO09126 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sema4dO09126 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Sema4dO09126 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sema4dO09126 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sema4dO09126 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sema4dO09126 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sema4dO09126 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sema4dO09126 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sema4dO09126 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sema4dO09126 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Sema4dO09126 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sema4dO09126 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Sema4dO09126 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sema4dO09126 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Sema4dO09126 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sema4dO09126 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sema4dO09126 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sema4dO09126 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sema4dO09126 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sema4dO09126 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sema4dO09126 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Sema4dO09126 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sema4dO09126 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sema4dO09126 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sema4dO09126 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sema4dO09126 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sema4dO09126 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sema4dO09126 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sema4dO09126 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sema4dO09126 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sema4dO09126 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sema4dO09126 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sema4dO09126 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sema4dO09126 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sema4dO09126 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sema4dO09126 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Sema4dO09126 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sema4dO09126 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sema4dO09126 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sema4dO09126 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sema4dO09126 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Sema4dO09126 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sema4dO09126 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sema4dO09126 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sema4dO09126 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sema4dO09126 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sema4dO09126 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sema4dO09126 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sema4dO09126 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sema4dO09126 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sema4dO09126 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sema4dO09126 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sema4dO09126 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sema4dO09126 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sema4dO09126 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sema4dO09126 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms