Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Eftud2O08810 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Eftud2O08810 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Eftud2O08810 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Eftud2O08810 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Eftud2O08810 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Eftud2O08810 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Eftud2O08810 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Eftud2O08810 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Eftud2O08810 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Eftud2O08810 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Eftud2O08810 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Eftud2O08810 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Eftud2O08810 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Eftud2O08810 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Eftud2O08810 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Eftud2O08810 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Eftud2O08810 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Eftud2O08810 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Eftud2O08810 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Eftud2O08810 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Eftud2O08810 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Eftud2O08810 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Eftud2O08810 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Eftud2O08810 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Eftud2O08810 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Eftud2O08810 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Eftud2O08810 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Eftud2O08810 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Eftud2O08810 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Eftud2O08810 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Eftud2O08810 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Eftud2O08810 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Eftud2O08810 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Eftud2O08810 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Eftud2O08810 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Eftud2O08810 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Eftud2O08810 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Eftud2O08810 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Eftud2O08810 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Eftud2O08810 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Eftud2O08810 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Eftud2O08810 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Eftud2O08810 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Eftud2O08810 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Eftud2O08810 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Eftud2O08810 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Eftud2O08810 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Eftud2O08810 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Eftud2O08810 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Eftud2O08810 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Eftud2O08810 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Eftud2O08810 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Eftud2O08810 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Eftud2O08810 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Eftud2O08810 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Eftud2O08810 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Eftud2O08810 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Eftud2O08810 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Eftud2O08810 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Eftud2O08810 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Eftud2O08810 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Eftud2O08810 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Eftud2O08810 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Eftud2O08810 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Eftud2O08810 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Eftud2O08810 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Eftud2O08810 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Eftud2O08810 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Eftud2O08810 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Eftud2O08810 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Eftud2O08810 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Eftud2O08810 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Eftud2O08810 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Eftud2O08810 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Eftud2O08810 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Eftud2O08810 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Eftud2O08810 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Eftud2O08810 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Eftud2O08810 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Eftud2O08810 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Eftud2O08810 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Eftud2O08810 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Eftud2O08810 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Eftud2O08810 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Eftud2O08810 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Eftud2O08810 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Eftud2O08810 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Eftud2O08810 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Eftud2O08810 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Eftud2O08810 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Eftud2O08810 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Eftud2O08810 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Eftud2O08810 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Eftud2O08810 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Eftud2O08810 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Eftud2O08810 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Eftud2O08810 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Eftud2O08810 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Eftud2O08810 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms