Protein–RNA interactions for Protein: O08736

Casp12, Caspase-12, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp12O08736 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Casp12O08736 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Casp12O08736 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Casp12O08736 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Casp12O08736 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Casp12O08736 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Casp12O08736 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Casp12O08736 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Casp12O08736 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Casp12O08736 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Casp12O08736 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Casp12O08736 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Casp12O08736 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Casp12O08736 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Casp12O08736 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Casp12O08736 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Casp12O08736 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Casp12O08736 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Casp12O08736 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Casp12O08736 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Casp12O08736 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Casp12O08736 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Casp12O08736 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Casp12O08736 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Casp12O08736 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Casp12O08736 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Casp12O08736 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Casp12O08736 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Casp12O08736 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Casp12O08736 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Casp12O08736 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Casp12O08736 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Casp12O08736 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Casp12O08736 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Casp12O08736 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Casp12O08736 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Casp12O08736 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Casp12O08736 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Casp12O08736 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Casp12O08736 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Casp12O08736 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Casp12O08736 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Casp12O08736 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Casp12O08736 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Casp12O08736 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Casp12O08736 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Casp12O08736 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Casp12O08736 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Casp12O08736 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Casp12O08736 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Casp12O08736 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Casp12O08736 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Casp12O08736 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Casp12O08736 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Casp12O08736 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Casp12O08736 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Casp12O08736 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Casp12O08736 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Casp12O08736 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Casp12O08736 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Casp12O08736 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Casp12O08736 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Casp12O08736 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Casp12O08736 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Casp12O08736 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Casp12O08736 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Casp12O08736 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Casp12O08736 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Casp12O08736 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Casp12O08736 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Casp12O08736 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Casp12O08736 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Casp12O08736 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Casp12O08736 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Casp12O08736 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Casp12O08736 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Casp12O08736 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Casp12O08736 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Casp12O08736 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Casp12O08736 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Casp12O08736 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Casp12O08736 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Casp12O08736 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Casp12O08736 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Casp12O08736 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Casp12O08736 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Casp12O08736 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Casp12O08736 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Casp12O08736 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Casp12O08736 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Casp12O08736 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Casp12O08736 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Casp12O08736 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Casp12O08736 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Casp12O08736 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Casp12O08736 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Casp12O08736 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Casp12O08736 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Casp12O08736 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Casp12O08736 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms