Protein–RNA interactions for Protein: L7N2B9

Gm3164, Predicted gene 3164, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3164L7N2B9 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm3164L7N2B9 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm3164L7N2B9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm3164L7N2B9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm3164L7N2B9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm3164L7N2B9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm3164L7N2B9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm3164L7N2B9 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm3164L7N2B9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm3164L7N2B9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm3164L7N2B9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm3164L7N2B9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm3164L7N2B9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm3164L7N2B9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm3164L7N2B9 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm3164L7N2B9 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm3164L7N2B9 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm3164L7N2B9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm3164L7N2B9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm3164L7N2B9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm3164L7N2B9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm3164L7N2B9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm3164L7N2B9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm3164L7N2B9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm3164L7N2B9 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm3164L7N2B9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm3164L7N2B9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm3164L7N2B9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm3164L7N2B9 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm3164L7N2B9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm3164L7N2B9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm3164L7N2B9 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm3164L7N2B9 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm3164L7N2B9 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm3164L7N2B9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm3164L7N2B9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm3164L7N2B9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm3164L7N2B9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm3164L7N2B9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm3164L7N2B9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm3164L7N2B9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm3164L7N2B9 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm3164L7N2B9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm3164L7N2B9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm3164L7N2B9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm3164L7N2B9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm3164L7N2B9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm3164L7N2B9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm3164L7N2B9 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm3164L7N2B9 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm3164L7N2B9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm3164L7N2B9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm3164L7N2B9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3164L7N2B9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3164L7N2B9 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3164L7N2B9 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3164L7N2B9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3164L7N2B9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3164L7N2B9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm3164L7N2B9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm3164L7N2B9 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm3164L7N2B9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm3164L7N2B9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm3164L7N2B9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm3164L7N2B9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm3164L7N2B9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm3164L7N2B9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm3164L7N2B9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm3164L7N2B9 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm3164L7N2B9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm3164L7N2B9 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm3164L7N2B9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm3164L7N2B9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm3164L7N2B9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm3164L7N2B9 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm3164L7N2B9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm3164L7N2B9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm3164L7N2B9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm3164L7N2B9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm3164L7N2B9 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm3164L7N2B9 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm3164L7N2B9 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm3164L7N2B9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm3164L7N2B9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm3164L7N2B9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm3164L7N2B9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm3164L7N2B9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm3164L7N2B9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm3164L7N2B9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm3164L7N2B9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm3164L7N2B9 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm3164L7N2B9 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm3164L7N2B9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm3164L7N2B9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm3164L7N2B9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm3164L7N2B9 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm3164L7N2B9 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm3164L7N2B9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm3164L7N2B9 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm3164L7N2B9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms