Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ27

Ccdc191, Coiled-coil domain-containing 191, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc191J3QQ27 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc191J3QQ27 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc191J3QQ27 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc191J3QQ27 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc191J3QQ27 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc191J3QQ27 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc191J3QQ27 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc191J3QQ27 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc191J3QQ27 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc191J3QQ27 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc191J3QQ27 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc191J3QQ27 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc191J3QQ27 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc191J3QQ27 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc191J3QQ27 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc191J3QQ27 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc191J3QQ27 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc191J3QQ27 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc191J3QQ27 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc191J3QQ27 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc191J3QQ27 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc191J3QQ27 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc191J3QQ27 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc191J3QQ27 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc191J3QQ27 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc191J3QQ27 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc191J3QQ27 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc191J3QQ27 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc191J3QQ27 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc191J3QQ27 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc191J3QQ27 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc191J3QQ27 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc191J3QQ27 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc191J3QQ27 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc191J3QQ27 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc191J3QQ27 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc191J3QQ27 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc191J3QQ27 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc191J3QQ27 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc191J3QQ27 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc191J3QQ27 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc191J3QQ27 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc191J3QQ27 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc191J3QQ27 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc191J3QQ27 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ccdc191J3QQ27 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ccdc191J3QQ27 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ccdc191J3QQ27 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc191J3QQ27 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc191J3QQ27 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc191J3QQ27 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc191J3QQ27 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc191J3QQ27 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc191J3QQ27 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc191J3QQ27 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc191J3QQ27 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc191J3QQ27 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc191J3QQ27 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc191J3QQ27 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc191J3QQ27 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc191J3QQ27 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc191J3QQ27 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc191J3QQ27 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc191J3QQ27 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc191J3QQ27 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc191J3QQ27 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc191J3QQ27 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc191J3QQ27 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc191J3QQ27 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc191J3QQ27 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc191J3QQ27 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc191J3QQ27 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc191J3QQ27 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc191J3QQ27 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc191J3QQ27 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc191J3QQ27 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc191J3QQ27 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc191J3QQ27 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc191J3QQ27 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc191J3QQ27 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc191J3QQ27 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc191J3QQ27 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc191J3QQ27 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc191J3QQ27 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc191J3QQ27 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc191J3QQ27 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc191J3QQ27 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc191J3QQ27 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc191J3QQ27 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc191J3QQ27 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc191J3QQ27 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc191J3QQ27 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc191J3QQ27 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc191J3QQ27 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc191J3QQ27 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc191J3QQ27 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc191J3QQ27 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc191J3QQ27 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc191J3QQ27 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc191J3QQ27 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms