Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Ccer2J3QPU5 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Ccer2J3QPU5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Ccer2J3QPU5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Ccer2J3QPU5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Ccer2J3QPU5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Ccer2J3QPU5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Ccer2J3QPU5 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Ccer2J3QPU5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Ccer2J3QPU5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Ccer2J3QPU5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Ccer2J3QPU5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Ccer2J3QPU5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Ccer2J3QPU5 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Ccer2J3QPU5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Ccer2J3QPU5 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Ccer2J3QPU5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Ccer2J3QPU5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Ccer2J3QPU5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Ccer2J3QPU5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Ccer2J3QPU5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Ccer2J3QPU5 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Ccer2J3QPU5 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Ccer2J3QPU5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Ccer2J3QPU5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Ccer2J3QPU5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Ccer2J3QPU5 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Ccer2J3QPU5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Ccer2J3QPU5 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Ccer2J3QPU5 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Ccer2J3QPU5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Ccer2J3QPU5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
Ccer2J3QPU5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Ccer2J3QPU5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Ccer2J3QPU5 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Ccer2J3QPU5 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Ccer2J3QPU5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Ccer2J3QPU5 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
Ccer2J3QPU5 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Ccer2J3QPU5 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Ccer2J3QPU5 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Ccer2J3QPU5 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Ccer2J3QPU5 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Ccer2J3QPU5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Ccer2J3QPU5 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Ccer2J3QPU5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Ccer2J3QPU5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Ccer2J3QPU5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Ccer2J3QPU5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Ccer2J3QPU5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Ccer2J3QPU5 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Ccer2J3QPU5 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Ccer2J3QPU5 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Ccer2J3QPU5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Ccer2J3QPU5 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Ccer2J3QPU5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Ccer2J3QPU5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Ccer2J3QPU5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Ccer2J3QPU5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Ccer2J3QPU5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Ccer2J3QPU5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Ccer2J3QPU5 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.41
Ccer2J3QPU5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Ccer2J3QPU5 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Ccer2J3QPU5 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Ccer2J3QPU5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Ccer2J3QPU5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Ccer2J3QPU5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Ccer2J3QPU5 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Ccer2J3QPU5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ccer2J3QPU5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ccer2J3QPU5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ccer2J3QPU5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ccer2J3QPU5 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ccer2J3QPU5 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ccer2J3QPU5 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
Ccer2J3QPU5 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ccer2J3QPU5 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ccer2J3QPU5 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Ccer2J3QPU5 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Ccer2J3QPU5 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Ccer2J3QPU5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Ccer2J3QPU5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ccer2J3QPU5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ccer2J3QPU5 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ccer2J3QPU5 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ccer2J3QPU5 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
Ccer2J3QPU5 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ccer2J3QPU5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ccer2J3QPU5 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ccer2J3QPU5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Ccer2J3QPU5 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Ccer2J3QPU5 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Ccer2J3QPU5 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
Ccer2J3QPU5 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Ccer2J3QPU5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Ccer2J3QPU5 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Ccer2J3QPU5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Ccer2J3QPU5 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Ccer2J3QPU5 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms