Protein–RNA interactions for Protein: J3QN14

Zfp616, Zinc finger protein 616, mousemouse

Predictions only

Length 987 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp616J3QN14 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Zfp616J3QN14 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Zfp616J3QN14 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Zfp616J3QN14 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Zfp616J3QN14 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Zfp616J3QN14 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Zfp616J3QN14 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Zfp616J3QN14 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Zfp616J3QN14 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Zfp616J3QN14 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Zfp616J3QN14 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Zfp616J3QN14 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Zfp616J3QN14 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Zfp616J3QN14 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Zfp616J3QN14 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Zfp616J3QN14 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Zfp616J3QN14 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Zfp616J3QN14 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Zfp616J3QN14 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Zfp616J3QN14 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Zfp616J3QN14 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Zfp616J3QN14 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Zfp616J3QN14 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Zfp616J3QN14 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Zfp616J3QN14 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Zfp616J3QN14 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Zfp616J3QN14 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Zfp616J3QN14 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Zfp616J3QN14 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Zfp616J3QN14 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Zfp616J3QN14 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Zfp616J3QN14 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Zfp616J3QN14 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Zfp616J3QN14 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Zfp616J3QN14 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Zfp616J3QN14 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Zfp616J3QN14 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Zfp616J3QN14 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Zfp616J3QN14 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Zfp616J3QN14 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Zfp616J3QN14 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Zfp616J3QN14 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Zfp616J3QN14 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Zfp616J3QN14 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Zfp616J3QN14 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Zfp616J3QN14 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Zfp616J3QN14 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Zfp616J3QN14 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Zfp616J3QN14 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Zfp616J3QN14 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Zfp616J3QN14 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Zfp616J3QN14 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Zfp616J3QN14 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Zfp616J3QN14 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zfp616J3QN14 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zfp616J3QN14 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zfp616J3QN14 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zfp616J3QN14 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zfp616J3QN14 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zfp616J3QN14 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zfp616J3QN14 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zfp616J3QN14 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Zfp616J3QN14 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zfp616J3QN14 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zfp616J3QN14 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zfp616J3QN14 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zfp616J3QN14 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zfp616J3QN14 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zfp616J3QN14 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zfp616J3QN14 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zfp616J3QN14 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zfp616J3QN14 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zfp616J3QN14 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zfp616J3QN14 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zfp616J3QN14 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zfp616J3QN14 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zfp616J3QN14 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zfp616J3QN14 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Zfp616J3QN14 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zfp616J3QN14 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zfp616J3QN14 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zfp616J3QN14 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zfp616J3QN14 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zfp616J3QN14 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Zfp616J3QN14 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Zfp616J3QN14 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Zfp616J3QN14 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Zfp616J3QN14 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Zfp616J3QN14 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Zfp616J3QN14 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Zfp616J3QN14 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Zfp616J3QN14 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Zfp616J3QN14 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Zfp616J3QN14 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zfp616J3QN14 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zfp616J3QN14 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zfp616J3QN14 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zfp616J3QN14 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zfp616J3QN14 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zfp616J3QN14 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.9 ms