Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

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Length 315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm3415J3QMS8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm3415J3QMS8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm3415J3QMS8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm3415J3QMS8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm3415J3QMS8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm3415J3QMS8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm3415J3QMS8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm3415J3QMS8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm3415J3QMS8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm3415J3QMS8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm3415J3QMS8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm3415J3QMS8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm3415J3QMS8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm3415J3QMS8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm3415J3QMS8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm3415J3QMS8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm3415J3QMS8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm3415J3QMS8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm3415J3QMS8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm3415J3QMS8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm3415J3QMS8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm3415J3QMS8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm3415J3QMS8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm3415J3QMS8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm3415J3QMS8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm3415J3QMS8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm3415J3QMS8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm3415J3QMS8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm3415J3QMS8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm3415J3QMS8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm3415J3QMS8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm3415J3QMS8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm3415J3QMS8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm3415J3QMS8 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm3415J3QMS8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm3415J3QMS8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm3415J3QMS8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm3415J3QMS8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm3415J3QMS8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm3415J3QMS8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm3415J3QMS8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm3415J3QMS8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm3415J3QMS8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm3415J3QMS8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm3415J3QMS8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm3415J3QMS8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm3415J3QMS8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm3415J3QMS8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm3415J3QMS8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm3415J3QMS8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm3415J3QMS8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm3415J3QMS8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm3415J3QMS8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm3415J3QMS8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm3415J3QMS8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm3415J3QMS8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm3415J3QMS8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm3415J3QMS8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm3415J3QMS8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm3415J3QMS8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm3415J3QMS8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm3415J3QMS8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm3415J3QMS8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm3415J3QMS8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm3415J3QMS8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm3415J3QMS8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm3415J3QMS8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm3415J3QMS8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm3415J3QMS8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm3415J3QMS8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm3415J3QMS8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm3415J3QMS8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm3415J3QMS8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm3415J3QMS8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm3415J3QMS8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm3415J3QMS8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm3415J3QMS8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gm3415J3QMS8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm3415J3QMS8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm3415J3QMS8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm3415J3QMS8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm3415J3QMS8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm3415J3QMS8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm3415J3QMS8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm3415J3QMS8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm3415J3QMS8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm3415J3QMS8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm3415J3QMS8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm3415J3QMS8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm3415J3QMS8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm3415J3QMS8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm3415J3QMS8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm3415J3QMS8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm3415J3QMS8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm3415J3QMS8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm3415J3QMS8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm3415J3QMS8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm3415J3QMS8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm3415J3QMS8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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