Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ6

Gm3336, Predicted gene 3336, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3336J3QMQ6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm3336J3QMQ6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm3336J3QMQ6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm3336J3QMQ6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm3336J3QMQ6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm3336J3QMQ6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm3336J3QMQ6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm3336J3QMQ6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm3336J3QMQ6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm3336J3QMQ6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm3336J3QMQ6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm3336J3QMQ6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm3336J3QMQ6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm3336J3QMQ6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm3336J3QMQ6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm3336J3QMQ6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm3336J3QMQ6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm3336J3QMQ6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm3336J3QMQ6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm3336J3QMQ6 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm3336J3QMQ6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm3336J3QMQ6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm3336J3QMQ6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm3336J3QMQ6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm3336J3QMQ6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm3336J3QMQ6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm3336J3QMQ6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm3336J3QMQ6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm3336J3QMQ6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm3336J3QMQ6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm3336J3QMQ6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm3336J3QMQ6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm3336J3QMQ6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm3336J3QMQ6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm3336J3QMQ6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm3336J3QMQ6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm3336J3QMQ6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm3336J3QMQ6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm3336J3QMQ6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm3336J3QMQ6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm3336J3QMQ6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm3336J3QMQ6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm3336J3QMQ6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm3336J3QMQ6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm3336J3QMQ6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm3336J3QMQ6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm3336J3QMQ6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Gm3336J3QMQ6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm3336J3QMQ6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm3336J3QMQ6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm3336J3QMQ6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm3336J3QMQ6 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gm3336J3QMQ6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Gm3336J3QMQ6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Gm3336J3QMQ6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm3336J3QMQ6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm3336J3QMQ6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm3336J3QMQ6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm3336J3QMQ6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm3336J3QMQ6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm3336J3QMQ6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm3336J3QMQ6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm3336J3QMQ6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm3336J3QMQ6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm3336J3QMQ6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm3336J3QMQ6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm3336J3QMQ6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm3336J3QMQ6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm3336J3QMQ6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm3336J3QMQ6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm3336J3QMQ6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Gm3336J3QMQ6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm3336J3QMQ6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm3336J3QMQ6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm3336J3QMQ6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm3336J3QMQ6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm3336J3QMQ6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm3336J3QMQ6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm3336J3QMQ6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm3336J3QMQ6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm3336J3QMQ6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm3336J3QMQ6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm3336J3QMQ6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Gm3336J3QMQ6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm3336J3QMQ6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gm3336J3QMQ6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm3336J3QMQ6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm3336J3QMQ6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm3336J3QMQ6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm3336J3QMQ6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm3336J3QMQ6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm3336J3QMQ6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm3336J3QMQ6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm3336J3QMQ6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm3336J3QMQ6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm3336J3QMQ6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm3336J3QMQ6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm3336J3QMQ6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm3336J3QMQ6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm3336J3QMQ6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
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