Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r58G3X9U3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r58G3X9U3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r58G3X9U3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r58G3X9U3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r58G3X9U3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r58G3X9U3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r58G3X9U3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r58G3X9U3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r58G3X9U3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r58G3X9U3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r58G3X9U3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r58G3X9U3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r58G3X9U3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r58G3X9U3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r58G3X9U3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r58G3X9U3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r58G3X9U3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r58G3X9U3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r58G3X9U3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r58G3X9U3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r58G3X9U3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r58G3X9U3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r58G3X9U3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r58G3X9U3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r58G3X9U3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r58G3X9U3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r58G3X9U3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r58G3X9U3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r58G3X9U3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r58G3X9U3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r58G3X9U3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r58G3X9U3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r58G3X9U3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r58G3X9U3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r58G3X9U3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r58G3X9U3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r58G3X9U3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r58G3X9U3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r58G3X9U3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r58G3X9U3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r58G3X9U3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r58G3X9U3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r58G3X9U3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r58G3X9U3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r58G3X9U3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r58G3X9U3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r58G3X9U3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r58G3X9U3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r58G3X9U3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r58G3X9U3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r58G3X9U3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r58G3X9U3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r58G3X9U3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r58G3X9U3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r58G3X9U3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r58G3X9U3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r58G3X9U3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r58G3X9U3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r58G3X9U3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r58G3X9U3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r58G3X9U3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r58G3X9U3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r58G3X9U3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r58G3X9U3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r58G3X9U3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r58G3X9U3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r58G3X9U3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r58G3X9U3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r58G3X9U3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r58G3X9U3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r58G3X9U3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r58G3X9U3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r58G3X9U3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r58G3X9U3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r58G3X9U3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r58G3X9U3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r58G3X9U3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r58G3X9U3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r58G3X9U3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Vmn1r58G3X9U3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Vmn1r58G3X9U3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Vmn1r58G3X9U3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r58G3X9U3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r58G3X9U3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r58G3X9U3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r58G3X9U3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r58G3X9U3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r58G3X9U3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r58G3X9U3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r58G3X9U3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r58G3X9U3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r58G3X9U3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r58G3X9U3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r58G3X9U3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r58G3X9U3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r58G3X9U3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r58G3X9U3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r58G3X9U3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r58G3X9U3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms