Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Z7

Chrna9, Cholinergic receptor, nicotinic, alpha polypeptide 9, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna9G3X8Z7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chrna9G3X8Z7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chrna9G3X8Z7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chrna9G3X8Z7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chrna9G3X8Z7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chrna9G3X8Z7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Chrna9G3X8Z7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chrna9G3X8Z7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Chrna9G3X8Z7 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chrna9G3X8Z7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chrna9G3X8Z7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chrna9G3X8Z7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chrna9G3X8Z7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Chrna9G3X8Z7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Chrna9G3X8Z7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Chrna9G3X8Z7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Chrna9G3X8Z7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Chrna9G3X8Z7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Chrna9G3X8Z7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Chrna9G3X8Z7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Chrna9G3X8Z7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Chrna9G3X8Z7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Chrna9G3X8Z7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Chrna9G3X8Z7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Chrna9G3X8Z7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chrna9G3X8Z7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chrna9G3X8Z7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chrna9G3X8Z7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chrna9G3X8Z7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chrna9G3X8Z7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chrna9G3X8Z7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chrna9G3X8Z7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chrna9G3X8Z7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chrna9G3X8Z7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chrna9G3X8Z7 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chrna9G3X8Z7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chrna9G3X8Z7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chrna9G3X8Z7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chrna9G3X8Z7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chrna9G3X8Z7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chrna9G3X8Z7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chrna9G3X8Z7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chrna9G3X8Z7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Chrna9G3X8Z7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chrna9G3X8Z7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chrna9G3X8Z7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chrna9G3X8Z7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chrna9G3X8Z7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chrna9G3X8Z7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chrna9G3X8Z7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chrna9G3X8Z7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chrna9G3X8Z7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chrna9G3X8Z7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chrna9G3X8Z7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chrna9G3X8Z7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chrna9G3X8Z7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chrna9G3X8Z7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chrna9G3X8Z7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chrna9G3X8Z7 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chrna9G3X8Z7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chrna9G3X8Z7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chrna9G3X8Z7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chrna9G3X8Z7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chrna9G3X8Z7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chrna9G3X8Z7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chrna9G3X8Z7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chrna9G3X8Z7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chrna9G3X8Z7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chrna9G3X8Z7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Chrna9G3X8Z7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Chrna9G3X8Z7 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Chrna9G3X8Z7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Chrna9G3X8Z7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chrna9G3X8Z7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chrna9G3X8Z7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chrna9G3X8Z7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chrna9G3X8Z7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chrna9G3X8Z7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chrna9G3X8Z7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chrna9G3X8Z7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chrna9G3X8Z7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chrna9G3X8Z7 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chrna9G3X8Z7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chrna9G3X8Z7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chrna9G3X8Z7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chrna9G3X8Z7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chrna9G3X8Z7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Chrna9G3X8Z7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chrna9G3X8Z7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chrna9G3X8Z7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chrna9G3X8Z7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chrna9G3X8Z7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chrna9G3X8Z7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chrna9G3X8Z7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chrna9G3X8Z7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chrna9G3X8Z7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chrna9G3X8Z7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chrna9G3X8Z7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Chrna9G3X8Z7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Chrna9G3X8Z7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms