Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ94

Pira2, Paired-Ig-like receptor A2, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pira2F8VQ94 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pira2F8VQ94 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pira2F8VQ94 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pira2F8VQ94 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pira2F8VQ94 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Pira2F8VQ94 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pira2F8VQ94 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pira2F8VQ94 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pira2F8VQ94 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pira2F8VQ94 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pira2F8VQ94 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pira2F8VQ94 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pira2F8VQ94 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pira2F8VQ94 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pira2F8VQ94 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pira2F8VQ94 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pira2F8VQ94 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pira2F8VQ94 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pira2F8VQ94 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pira2F8VQ94 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pira2F8VQ94 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pira2F8VQ94 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pira2F8VQ94 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pira2F8VQ94 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pira2F8VQ94 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pira2F8VQ94 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Pira2F8VQ94 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pira2F8VQ94 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pira2F8VQ94 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pira2F8VQ94 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pira2F8VQ94 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pira2F8VQ94 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pira2F8VQ94 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Pira2F8VQ94 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pira2F8VQ94 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pira2F8VQ94 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pira2F8VQ94 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pira2F8VQ94 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pira2F8VQ94 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pira2F8VQ94 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pira2F8VQ94 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pira2F8VQ94 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pira2F8VQ94 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pira2F8VQ94 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pira2F8VQ94 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pira2F8VQ94 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pira2F8VQ94 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pira2F8VQ94 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pira2F8VQ94 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pira2F8VQ94 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pira2F8VQ94 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pira2F8VQ94 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pira2F8VQ94 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pira2F8VQ94 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pira2F8VQ94 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pira2F8VQ94 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pira2F8VQ94 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pira2F8VQ94 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pira2F8VQ94 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pira2F8VQ94 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pira2F8VQ94 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pira2F8VQ94 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pira2F8VQ94 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pira2F8VQ94 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Pira2F8VQ94 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pira2F8VQ94 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pira2F8VQ94 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pira2F8VQ94 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pira2F8VQ94 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pira2F8VQ94 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pira2F8VQ94 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pira2F8VQ94 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pira2F8VQ94 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pira2F8VQ94 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pira2F8VQ94 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pira2F8VQ94 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pira2F8VQ94 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pira2F8VQ94 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pira2F8VQ94 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pira2F8VQ94 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pira2F8VQ94 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Pira2F8VQ94 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pira2F8VQ94 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pira2F8VQ94 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pira2F8VQ94 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pira2F8VQ94 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pira2F8VQ94 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pira2F8VQ94 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pira2F8VQ94 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pira2F8VQ94 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pira2F8VQ94 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pira2F8VQ94 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pira2F8VQ94 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Pira2F8VQ94 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pira2F8VQ94 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Pira2F8VQ94 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pira2F8VQ94 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pira2F8VQ94 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pira2F8VQ94 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pira2F8VQ94 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms