Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ScaperF8VQ70 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
ScaperF8VQ70 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ScaperF8VQ70 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ScaperF8VQ70 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ScaperF8VQ70 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ScaperF8VQ70 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ScaperF8VQ70 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ScaperF8VQ70 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ScaperF8VQ70 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ScaperF8VQ70 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ScaperF8VQ70 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ScaperF8VQ70 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ScaperF8VQ70 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ScaperF8VQ70 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ScaperF8VQ70 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ScaperF8VQ70 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ScaperF8VQ70 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ScaperF8VQ70 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ScaperF8VQ70 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
ScaperF8VQ70 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ScaperF8VQ70 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
ScaperF8VQ70 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ScaperF8VQ70 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ScaperF8VQ70 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ScaperF8VQ70 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ScaperF8VQ70 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ScaperF8VQ70 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ScaperF8VQ70 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ScaperF8VQ70 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
ScaperF8VQ70 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ScaperF8VQ70 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ScaperF8VQ70 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ScaperF8VQ70 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ScaperF8VQ70 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ScaperF8VQ70 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ScaperF8VQ70 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ScaperF8VQ70 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
ScaperF8VQ70 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ScaperF8VQ70 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ScaperF8VQ70 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ScaperF8VQ70 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ScaperF8VQ70 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ScaperF8VQ70 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ScaperF8VQ70 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ScaperF8VQ70 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ScaperF8VQ70 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ScaperF8VQ70 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ScaperF8VQ70 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ScaperF8VQ70 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
ScaperF8VQ70 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ScaperF8VQ70 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ScaperF8VQ70 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ScaperF8VQ70 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ScaperF8VQ70 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ScaperF8VQ70 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ScaperF8VQ70 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ScaperF8VQ70 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ScaperF8VQ70 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ScaperF8VQ70 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ScaperF8VQ70 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ScaperF8VQ70 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ScaperF8VQ70 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ScaperF8VQ70 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ScaperF8VQ70 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ScaperF8VQ70 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
ScaperF8VQ70 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ScaperF8VQ70 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ScaperF8VQ70 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ScaperF8VQ70 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
ScaperF8VQ70 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
ScaperF8VQ70 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
ScaperF8VQ70 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ScaperF8VQ70 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ScaperF8VQ70 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ScaperF8VQ70 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ScaperF8VQ70 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ScaperF8VQ70 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ScaperF8VQ70 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ScaperF8VQ70 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ScaperF8VQ70 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ScaperF8VQ70 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ScaperF8VQ70 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ScaperF8VQ70 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ScaperF8VQ70 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ScaperF8VQ70 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ScaperF8VQ70 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
ScaperF8VQ70 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ScaperF8VQ70 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
ScaperF8VQ70 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ScaperF8VQ70 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ScaperF8VQ70 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ScaperF8VQ70 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ScaperF8VQ70 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ScaperF8VQ70 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ScaperF8VQ70 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ScaperF8VQ70 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ScaperF8VQ70 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ScaperF8VQ70 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ScaperF8VQ70 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms