Protein–RNA interactions for Protein: F6Y2A6

Gm5689, Predicted gene 5689, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5689F6Y2A6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm5689F6Y2A6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm5689F6Y2A6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm5689F6Y2A6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm5689F6Y2A6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm5689F6Y2A6 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm5689F6Y2A6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm5689F6Y2A6 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm5689F6Y2A6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm5689F6Y2A6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm5689F6Y2A6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm5689F6Y2A6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm5689F6Y2A6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm5689F6Y2A6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm5689F6Y2A6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm5689F6Y2A6 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm5689F6Y2A6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm5689F6Y2A6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm5689F6Y2A6 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm5689F6Y2A6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm5689F6Y2A6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm5689F6Y2A6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm5689F6Y2A6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm5689F6Y2A6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm5689F6Y2A6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm5689F6Y2A6 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm5689F6Y2A6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm5689F6Y2A6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm5689F6Y2A6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm5689F6Y2A6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm5689F6Y2A6 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm5689F6Y2A6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm5689F6Y2A6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm5689F6Y2A6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gm5689F6Y2A6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Gm5689F6Y2A6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gm5689F6Y2A6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm5689F6Y2A6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm5689F6Y2A6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm5689F6Y2A6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm5689F6Y2A6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm5689F6Y2A6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm5689F6Y2A6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm5689F6Y2A6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm5689F6Y2A6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm5689F6Y2A6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm5689F6Y2A6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm5689F6Y2A6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm5689F6Y2A6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm5689F6Y2A6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm5689F6Y2A6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm5689F6Y2A6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm5689F6Y2A6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm5689F6Y2A6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm5689F6Y2A6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm5689F6Y2A6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm5689F6Y2A6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm5689F6Y2A6 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm5689F6Y2A6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm5689F6Y2A6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm5689F6Y2A6 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm5689F6Y2A6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm5689F6Y2A6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm5689F6Y2A6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm5689F6Y2A6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm5689F6Y2A6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gm5689F6Y2A6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm5689F6Y2A6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm5689F6Y2A6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm5689F6Y2A6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Gm5689F6Y2A6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm5689F6Y2A6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Gm5689F6Y2A6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm5689F6Y2A6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm5689F6Y2A6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm5689F6Y2A6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gm5689F6Y2A6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm5689F6Y2A6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm5689F6Y2A6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm5689F6Y2A6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm5689F6Y2A6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm5689F6Y2A6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm5689F6Y2A6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm5689F6Y2A6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm5689F6Y2A6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm5689F6Y2A6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm5689F6Y2A6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm5689F6Y2A6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm5689F6Y2A6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm5689F6Y2A6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm5689F6Y2A6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm5689F6Y2A6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm5689F6Y2A6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm5689F6Y2A6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm5689F6Y2A6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm5689F6Y2A6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm5689F6Y2A6 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm5689F6Y2A6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm5689F6Y2A6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm5689F6Y2A6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms