Protein–RNA interactions for Protein: F6VLK5

Gm10722, Predicted gene 10722, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10722F6VLK5 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm10722F6VLK5 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm10722F6VLK5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm10722F6VLK5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm10722F6VLK5 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm10722F6VLK5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm10722F6VLK5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm10722F6VLK5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm10722F6VLK5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm10722F6VLK5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm10722F6VLK5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm10722F6VLK5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm10722F6VLK5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm10722F6VLK5 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm10722F6VLK5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm10722F6VLK5 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm10722F6VLK5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm10722F6VLK5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm10722F6VLK5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm10722F6VLK5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm10722F6VLK5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm10722F6VLK5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm10722F6VLK5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm10722F6VLK5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm10722F6VLK5 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm10722F6VLK5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm10722F6VLK5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm10722F6VLK5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm10722F6VLK5 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm10722F6VLK5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm10722F6VLK5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm10722F6VLK5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm10722F6VLK5 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm10722F6VLK5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm10722F6VLK5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm10722F6VLK5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm10722F6VLK5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm10722F6VLK5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm10722F6VLK5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm10722F6VLK5 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Gm10722F6VLK5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Gm10722F6VLK5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm10722F6VLK5 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm10722F6VLK5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm10722F6VLK5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm10722F6VLK5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm10722F6VLK5 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm10722F6VLK5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm10722F6VLK5 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm10722F6VLK5 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm10722F6VLK5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm10722F6VLK5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm10722F6VLK5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm10722F6VLK5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm10722F6VLK5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm10722F6VLK5 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm10722F6VLK5 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm10722F6VLK5 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm10722F6VLK5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm10722F6VLK5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm10722F6VLK5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm10722F6VLK5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm10722F6VLK5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm10722F6VLK5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm10722F6VLK5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm10722F6VLK5 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm10722F6VLK5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm10722F6VLK5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm10722F6VLK5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm10722F6VLK5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm10722F6VLK5 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm10722F6VLK5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm10722F6VLK5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm10722F6VLK5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm10722F6VLK5 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm10722F6VLK5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm10722F6VLK5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm10722F6VLK5 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm10722F6VLK5 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm10722F6VLK5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm10722F6VLK5 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm10722F6VLK5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm10722F6VLK5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm10722F6VLK5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm10722F6VLK5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm10722F6VLK5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm10722F6VLK5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm10722F6VLK5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm10722F6VLK5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm10722F6VLK5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm10722F6VLK5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm10722F6VLK5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm10722F6VLK5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm10722F6VLK5 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm10722F6VLK5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm10722F6VLK5 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm10722F6VLK5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm10722F6VLK5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm10722F6VLK5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm10722F6VLK5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms