Protein–RNA interactions for Protein: F6V0H0

Pagr1b, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1B (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1bF6V0H0 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Pagr1bF6V0H0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pagr1bF6V0H0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pagr1bF6V0H0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pagr1bF6V0H0 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pagr1bF6V0H0 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pagr1bF6V0H0 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pagr1bF6V0H0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pagr1bF6V0H0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pagr1bF6V0H0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pagr1bF6V0H0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pagr1bF6V0H0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pagr1bF6V0H0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pagr1bF6V0H0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pagr1bF6V0H0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pagr1bF6V0H0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pagr1bF6V0H0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pagr1bF6V0H0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pagr1bF6V0H0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pagr1bF6V0H0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pagr1bF6V0H0 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pagr1bF6V0H0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pagr1bF6V0H0 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pagr1bF6V0H0 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Pagr1bF6V0H0 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pagr1bF6V0H0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pagr1bF6V0H0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pagr1bF6V0H0 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pagr1bF6V0H0 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pagr1bF6V0H0 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pagr1bF6V0H0 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pagr1bF6V0H0 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pagr1bF6V0H0 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pagr1bF6V0H0 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pagr1bF6V0H0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pagr1bF6V0H0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pagr1bF6V0H0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pagr1bF6V0H0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pagr1bF6V0H0 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pagr1bF6V0H0 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pagr1bF6V0H0 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Pagr1bF6V0H0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pagr1bF6V0H0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pagr1bF6V0H0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pagr1bF6V0H0 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pagr1bF6V0H0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pagr1bF6V0H0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pagr1bF6V0H0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pagr1bF6V0H0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pagr1bF6V0H0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pagr1bF6V0H0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pagr1bF6V0H0 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pagr1bF6V0H0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pagr1bF6V0H0 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pagr1bF6V0H0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pagr1bF6V0H0 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pagr1bF6V0H0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pagr1bF6V0H0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pagr1bF6V0H0 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pagr1bF6V0H0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pagr1bF6V0H0 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pagr1bF6V0H0 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pagr1bF6V0H0 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pagr1bF6V0H0 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Pagr1bF6V0H0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pagr1bF6V0H0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pagr1bF6V0H0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pagr1bF6V0H0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pagr1bF6V0H0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pagr1bF6V0H0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pagr1bF6V0H0 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pagr1bF6V0H0 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Pagr1bF6V0H0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pagr1bF6V0H0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pagr1bF6V0H0 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pagr1bF6V0H0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pagr1bF6V0H0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pagr1bF6V0H0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pagr1bF6V0H0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pagr1bF6V0H0 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pagr1bF6V0H0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pagr1bF6V0H0 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pagr1bF6V0H0 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Pagr1bF6V0H0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pagr1bF6V0H0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pagr1bF6V0H0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pagr1bF6V0H0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pagr1bF6V0H0 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pagr1bF6V0H0 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pagr1bF6V0H0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pagr1bF6V0H0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pagr1bF6V0H0 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pagr1bF6V0H0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pagr1bF6V0H0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pagr1bF6V0H0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pagr1bF6V0H0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pagr1bF6V0H0 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pagr1bF6V0H0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Pagr1bF6V0H0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pagr1bF6V0H0 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms