Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Syngap1F6SEU4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Syngap1F6SEU4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Syngap1F6SEU4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Syngap1F6SEU4 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Syngap1F6SEU4 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Syngap1F6SEU4 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Syngap1F6SEU4 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Syngap1F6SEU4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Syngap1F6SEU4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Syngap1F6SEU4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Syngap1F6SEU4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Syngap1F6SEU4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Syngap1F6SEU4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Syngap1F6SEU4 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Syngap1F6SEU4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Syngap1F6SEU4 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Syngap1F6SEU4 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Syngap1F6SEU4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Syngap1F6SEU4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Syngap1F6SEU4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Syngap1F6SEU4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Syngap1F6SEU4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Syngap1F6SEU4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Syngap1F6SEU4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Syngap1F6SEU4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Syngap1F6SEU4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Syngap1F6SEU4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Syngap1F6SEU4 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Syngap1F6SEU4 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Syngap1F6SEU4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Syngap1F6SEU4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Syngap1F6SEU4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Syngap1F6SEU4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Syngap1F6SEU4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Syngap1F6SEU4 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Syngap1F6SEU4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Syngap1F6SEU4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Syngap1F6SEU4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Syngap1F6SEU4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Syngap1F6SEU4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Syngap1F6SEU4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Syngap1F6SEU4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Syngap1F6SEU4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Syngap1F6SEU4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Syngap1F6SEU4 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Syngap1F6SEU4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Syngap1F6SEU4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Syngap1F6SEU4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Syngap1F6SEU4 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Syngap1F6SEU4 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Syngap1F6SEU4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Syngap1F6SEU4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Syngap1F6SEU4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Syngap1F6SEU4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Syngap1F6SEU4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Syngap1F6SEU4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Syngap1F6SEU4 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Syngap1F6SEU4 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Syngap1F6SEU4 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Syngap1F6SEU4 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Syngap1F6SEU4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Syngap1F6SEU4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Syngap1F6SEU4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Syngap1F6SEU4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Syngap1F6SEU4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Syngap1F6SEU4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Syngap1F6SEU4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Syngap1F6SEU4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Syngap1F6SEU4 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Syngap1F6SEU4 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Syngap1F6SEU4 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Syngap1F6SEU4 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Syngap1F6SEU4 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Syngap1F6SEU4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Syngap1F6SEU4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Syngap1F6SEU4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Syngap1F6SEU4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Syngap1F6SEU4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Syngap1F6SEU4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Syngap1F6SEU4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Syngap1F6SEU4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Syngap1F6SEU4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Syngap1F6SEU4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Syngap1F6SEU4 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Syngap1F6SEU4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Syngap1F6SEU4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Syngap1F6SEU4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Syngap1F6SEU4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Syngap1F6SEU4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Syngap1F6SEU4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Syngap1F6SEU4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Syngap1F6SEU4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Syngap1F6SEU4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Syngap1F6SEU4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Syngap1F6SEU4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Syngap1F6SEU4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Syngap1F6SEU4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Syngap1F6SEU4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Syngap1F6SEU4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms