Protein–RNA interactions for Protein: F6R3P9

Prl3d2, Growth hormone d5, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prl3d2F6R3P9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prl3d2F6R3P9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prl3d2F6R3P9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Prl3d2F6R3P9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Prl3d2F6R3P9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Prl3d2F6R3P9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Prl3d2F6R3P9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Prl3d2F6R3P9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prl3d2F6R3P9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prl3d2F6R3P9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prl3d2F6R3P9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prl3d2F6R3P9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prl3d2F6R3P9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prl3d2F6R3P9 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Prl3d2F6R3P9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prl3d2F6R3P9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prl3d2F6R3P9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prl3d2F6R3P9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prl3d2F6R3P9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prl3d2F6R3P9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prl3d2F6R3P9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prl3d2F6R3P9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prl3d2F6R3P9 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prl3d2F6R3P9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prl3d2F6R3P9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prl3d2F6R3P9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Prl3d2F6R3P9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Prl3d2F6R3P9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Prl3d2F6R3P9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Prl3d2F6R3P9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prl3d2F6R3P9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prl3d2F6R3P9 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prl3d2F6R3P9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prl3d2F6R3P9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prl3d2F6R3P9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prl3d2F6R3P9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prl3d2F6R3P9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prl3d2F6R3P9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prl3d2F6R3P9 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prl3d2F6R3P9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prl3d2F6R3P9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prl3d2F6R3P9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prl3d2F6R3P9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prl3d2F6R3P9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prl3d2F6R3P9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prl3d2F6R3P9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prl3d2F6R3P9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prl3d2F6R3P9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prl3d2F6R3P9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prl3d2F6R3P9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prl3d2F6R3P9 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prl3d2F6R3P9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Prl3d2F6R3P9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prl3d2F6R3P9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prl3d2F6R3P9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prl3d2F6R3P9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prl3d2F6R3P9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prl3d2F6R3P9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prl3d2F6R3P9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prl3d2F6R3P9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prl3d2F6R3P9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prl3d2F6R3P9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Prl3d2F6R3P9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prl3d2F6R3P9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prl3d2F6R3P9 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prl3d2F6R3P9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prl3d2F6R3P9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Prl3d2F6R3P9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prl3d2F6R3P9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prl3d2F6R3P9 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prl3d2F6R3P9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prl3d2F6R3P9 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prl3d2F6R3P9 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Prl3d2F6R3P9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prl3d2F6R3P9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prl3d2F6R3P9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prl3d2F6R3P9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prl3d2F6R3P9 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prl3d2F6R3P9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Prl3d2F6R3P9 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prl3d2F6R3P9 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prl3d2F6R3P9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prl3d2F6R3P9 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prl3d2F6R3P9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prl3d2F6R3P9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prl3d2F6R3P9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Prl3d2F6R3P9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Prl3d2F6R3P9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prl3d2F6R3P9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prl3d2F6R3P9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prl3d2F6R3P9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prl3d2F6R3P9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prl3d2F6R3P9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prl3d2F6R3P9 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prl3d2F6R3P9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prl3d2F6R3P9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prl3d2F6R3P9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prl3d2F6R3P9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prl3d2F6R3P9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prl3d2F6R3P9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms