Protein–RNA interactions for Protein: F6QRE9

Erich3, Glutamate-rich 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erich3F6QRE9 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Erich3F6QRE9 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Erich3F6QRE9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Erich3F6QRE9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Erich3F6QRE9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Erich3F6QRE9 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Erich3F6QRE9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Erich3F6QRE9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Erich3F6QRE9 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Erich3F6QRE9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Erich3F6QRE9 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Erich3F6QRE9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Erich3F6QRE9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Erich3F6QRE9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Erich3F6QRE9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Erich3F6QRE9 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Erich3F6QRE9 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Erich3F6QRE9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Erich3F6QRE9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Erich3F6QRE9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Erich3F6QRE9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Erich3F6QRE9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Erich3F6QRE9 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Erich3F6QRE9 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Erich3F6QRE9 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Erich3F6QRE9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Erich3F6QRE9 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Erich3F6QRE9 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Erich3F6QRE9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Erich3F6QRE9 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Erich3F6QRE9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Erich3F6QRE9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Erich3F6QRE9 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Erich3F6QRE9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Erich3F6QRE9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Erich3F6QRE9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC32.14■■■□□ 2.73
Erich3F6QRE9 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Erich3F6QRE9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Erich3F6QRE9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Erich3F6QRE9 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Erich3F6QRE9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Erich3F6QRE9 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
Erich3F6QRE9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Erich3F6QRE9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Erich3F6QRE9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Erich3F6QRE9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Erich3F6QRE9 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Erich3F6QRE9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Erich3F6QRE9 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Erich3F6QRE9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Erich3F6QRE9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Erich3F6QRE9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Erich3F6QRE9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Erich3F6QRE9 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Erich3F6QRE9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Erich3F6QRE9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Erich3F6QRE9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Erich3F6QRE9 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Erich3F6QRE9 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Erich3F6QRE9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
Erich3F6QRE9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Erich3F6QRE9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Erich3F6QRE9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Erich3F6QRE9 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Erich3F6QRE9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Erich3F6QRE9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Erich3F6QRE9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Erich3F6QRE9 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Erich3F6QRE9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Erich3F6QRE9 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
Erich3F6QRE9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Erich3F6QRE9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Erich3F6QRE9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
Erich3F6QRE9 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
Erich3F6QRE9 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Erich3F6QRE9 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Erich3F6QRE9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Erich3F6QRE9 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Erich3F6QRE9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Erich3F6QRE9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Erich3F6QRE9 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
Erich3F6QRE9 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
Erich3F6QRE9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Erich3F6QRE9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Erich3F6QRE9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Erich3F6QRE9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Erich3F6QRE9 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Erich3F6QRE9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Erich3F6QRE9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Erich3F6QRE9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Erich3F6QRE9 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Erich3F6QRE9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Erich3F6QRE9 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.72
Erich3F6QRE9 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Erich3F6QRE9 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC32.01■■■□□ 2.72
Erich3F6QRE9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Erich3F6QRE9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Erich3F6QRE9 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
Erich3F6QRE9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
Erich3F6QRE9 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 286.5 ms