Protein–RNA interactions for Protein: F6Q785

Gm29094, Predicted gene 29094 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29094F6Q785 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm29094F6Q785 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm29094F6Q785 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm29094F6Q785 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm29094F6Q785 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm29094F6Q785 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm29094F6Q785 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm29094F6Q785 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm29094F6Q785 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm29094F6Q785 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm29094F6Q785 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm29094F6Q785 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm29094F6Q785 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm29094F6Q785 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm29094F6Q785 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm29094F6Q785 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm29094F6Q785 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm29094F6Q785 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm29094F6Q785 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm29094F6Q785 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm29094F6Q785 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm29094F6Q785 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm29094F6Q785 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm29094F6Q785 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm29094F6Q785 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm29094F6Q785 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm29094F6Q785 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm29094F6Q785 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm29094F6Q785 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm29094F6Q785 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm29094F6Q785 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm29094F6Q785 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm29094F6Q785 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm29094F6Q785 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm29094F6Q785 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm29094F6Q785 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm29094F6Q785 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm29094F6Q785 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm29094F6Q785 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm29094F6Q785 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm29094F6Q785 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm29094F6Q785 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm29094F6Q785 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm29094F6Q785 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm29094F6Q785 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm29094F6Q785 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm29094F6Q785 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm29094F6Q785 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm29094F6Q785 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm29094F6Q785 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm29094F6Q785 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm29094F6Q785 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm29094F6Q785 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm29094F6Q785 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm29094F6Q785 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm29094F6Q785 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm29094F6Q785 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm29094F6Q785 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm29094F6Q785 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm29094F6Q785 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm29094F6Q785 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm29094F6Q785 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm29094F6Q785 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm29094F6Q785 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm29094F6Q785 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm29094F6Q785 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm29094F6Q785 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm29094F6Q785 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gm29094F6Q785 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gm29094F6Q785 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gm29094F6Q785 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gm29094F6Q785 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm29094F6Q785 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm29094F6Q785 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm29094F6Q785 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm29094F6Q785 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm29094F6Q785 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm29094F6Q785 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm29094F6Q785 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm29094F6Q785 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm29094F6Q785 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm29094F6Q785 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm29094F6Q785 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm29094F6Q785 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm29094F6Q785 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm29094F6Q785 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm29094F6Q785 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm29094F6Q785 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm29094F6Q785 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm29094F6Q785 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm29094F6Q785 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm29094F6Q785 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm29094F6Q785 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm29094F6Q785 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm29094F6Q785 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm29094F6Q785 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm29094F6Q785 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm29094F6Q785 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm29094F6Q785 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm29094F6Q785 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms