Protein–RNA interactions for Protein: E9QAE3

Btaf1, B-TFIID TATA-box-binding protein-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,848 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Btaf1E9QAE3 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Btaf1E9QAE3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Btaf1E9QAE3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Btaf1E9QAE3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Btaf1E9QAE3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Btaf1E9QAE3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Btaf1E9QAE3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Btaf1E9QAE3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Btaf1E9QAE3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Btaf1E9QAE3 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Btaf1E9QAE3 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Btaf1E9QAE3 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Btaf1E9QAE3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Btaf1E9QAE3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Btaf1E9QAE3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Btaf1E9QAE3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Btaf1E9QAE3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Btaf1E9QAE3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Btaf1E9QAE3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Btaf1E9QAE3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Btaf1E9QAE3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Btaf1E9QAE3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Btaf1E9QAE3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Btaf1E9QAE3 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Btaf1E9QAE3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Btaf1E9QAE3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Btaf1E9QAE3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Btaf1E9QAE3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Btaf1E9QAE3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Btaf1E9QAE3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Btaf1E9QAE3 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Btaf1E9QAE3 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Btaf1E9QAE3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Btaf1E9QAE3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Btaf1E9QAE3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Btaf1E9QAE3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Btaf1E9QAE3 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Btaf1E9QAE3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Btaf1E9QAE3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Btaf1E9QAE3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Btaf1E9QAE3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Btaf1E9QAE3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Btaf1E9QAE3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Btaf1E9QAE3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Btaf1E9QAE3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Btaf1E9QAE3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Btaf1E9QAE3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Btaf1E9QAE3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Btaf1E9QAE3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Btaf1E9QAE3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Btaf1E9QAE3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Btaf1E9QAE3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Btaf1E9QAE3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Btaf1E9QAE3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Btaf1E9QAE3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Btaf1E9QAE3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Btaf1E9QAE3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Btaf1E9QAE3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Btaf1E9QAE3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Btaf1E9QAE3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Btaf1E9QAE3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Btaf1E9QAE3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Btaf1E9QAE3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Btaf1E9QAE3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Btaf1E9QAE3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Btaf1E9QAE3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Btaf1E9QAE3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Btaf1E9QAE3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Btaf1E9QAE3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Btaf1E9QAE3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Btaf1E9QAE3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Btaf1E9QAE3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Btaf1E9QAE3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Btaf1E9QAE3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Btaf1E9QAE3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Btaf1E9QAE3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Btaf1E9QAE3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Btaf1E9QAE3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Btaf1E9QAE3 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Btaf1E9QAE3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Btaf1E9QAE3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Btaf1E9QAE3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Btaf1E9QAE3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Btaf1E9QAE3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Btaf1E9QAE3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Btaf1E9QAE3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Btaf1E9QAE3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Btaf1E9QAE3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Btaf1E9QAE3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Btaf1E9QAE3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Btaf1E9QAE3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Btaf1E9QAE3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Btaf1E9QAE3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Btaf1E9QAE3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Btaf1E9QAE3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Btaf1E9QAE3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Btaf1E9QAE3 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Btaf1E9QAE3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Btaf1E9QAE3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Btaf1E9QAE3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms