Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Y3

Ccdc7b, Coiled-coil domain-containing 7B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7bE9Q9Y3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc7bE9Q9Y3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc7bE9Q9Y3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc7bE9Q9Y3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc7bE9Q9Y3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc7bE9Q9Y3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc7bE9Q9Y3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc7bE9Q9Y3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc7bE9Q9Y3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc7bE9Q9Y3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc7bE9Q9Y3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc7bE9Q9Y3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc7bE9Q9Y3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc7bE9Q9Y3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc7bE9Q9Y3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc7bE9Q9Y3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc7bE9Q9Y3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc7bE9Q9Y3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc7bE9Q9Y3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc7bE9Q9Y3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc7bE9Q9Y3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc7bE9Q9Y3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc7bE9Q9Y3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc7bE9Q9Y3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc7bE9Q9Y3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc7bE9Q9Y3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc7bE9Q9Y3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc7bE9Q9Y3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc7bE9Q9Y3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc7bE9Q9Y3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc7bE9Q9Y3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc7bE9Q9Y3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc7bE9Q9Y3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc7bE9Q9Y3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc7bE9Q9Y3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc7bE9Q9Y3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc7bE9Q9Y3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc7bE9Q9Y3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc7bE9Q9Y3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc7bE9Q9Y3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc7bE9Q9Y3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc7bE9Q9Y3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc7bE9Q9Y3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc7bE9Q9Y3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc7bE9Q9Y3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc7bE9Q9Y3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc7bE9Q9Y3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc7bE9Q9Y3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc7bE9Q9Y3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc7bE9Q9Y3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc7bE9Q9Y3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc7bE9Q9Y3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc7bE9Q9Y3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc7bE9Q9Y3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc7bE9Q9Y3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc7bE9Q9Y3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc7bE9Q9Y3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc7bE9Q9Y3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc7bE9Q9Y3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc7bE9Q9Y3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc7bE9Q9Y3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc7bE9Q9Y3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc7bE9Q9Y3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc7bE9Q9Y3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc7bE9Q9Y3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc7bE9Q9Y3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc7bE9Q9Y3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc7bE9Q9Y3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc7bE9Q9Y3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc7bE9Q9Y3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc7bE9Q9Y3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc7bE9Q9Y3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc7bE9Q9Y3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc7bE9Q9Y3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc7bE9Q9Y3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc7bE9Q9Y3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc7bE9Q9Y3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc7bE9Q9Y3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc7bE9Q9Y3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc7bE9Q9Y3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc7bE9Q9Y3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc7bE9Q9Y3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc7bE9Q9Y3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc7bE9Q9Y3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 163.5 ms