Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E9

Simc1, SUMO-interacting motifs-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Simc1E9Q6E9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Simc1E9Q6E9 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Simc1E9Q6E9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Simc1E9Q6E9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Simc1E9Q6E9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Simc1E9Q6E9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Simc1E9Q6E9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Simc1E9Q6E9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Simc1E9Q6E9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Simc1E9Q6E9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Simc1E9Q6E9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Simc1E9Q6E9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Simc1E9Q6E9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Simc1E9Q6E9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Simc1E9Q6E9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Simc1E9Q6E9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Simc1E9Q6E9 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Simc1E9Q6E9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Simc1E9Q6E9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Simc1E9Q6E9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Simc1E9Q6E9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Simc1E9Q6E9 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Simc1E9Q6E9 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Simc1E9Q6E9 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Simc1E9Q6E9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Simc1E9Q6E9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Simc1E9Q6E9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Simc1E9Q6E9 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Simc1E9Q6E9 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Simc1E9Q6E9 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Simc1E9Q6E9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Simc1E9Q6E9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Simc1E9Q6E9 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Simc1E9Q6E9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Simc1E9Q6E9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Simc1E9Q6E9 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Simc1E9Q6E9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Simc1E9Q6E9 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Simc1E9Q6E9 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Simc1E9Q6E9 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Simc1E9Q6E9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Simc1E9Q6E9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Simc1E9Q6E9 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Simc1E9Q6E9 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Simc1E9Q6E9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Simc1E9Q6E9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Simc1E9Q6E9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Simc1E9Q6E9 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Simc1E9Q6E9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Simc1E9Q6E9 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Simc1E9Q6E9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Simc1E9Q6E9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Simc1E9Q6E9 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Simc1E9Q6E9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Simc1E9Q6E9 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Simc1E9Q6E9 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Simc1E9Q6E9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Simc1E9Q6E9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Simc1E9Q6E9 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Simc1E9Q6E9 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Simc1E9Q6E9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Simc1E9Q6E9 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Simc1E9Q6E9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Simc1E9Q6E9 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Simc1E9Q6E9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Simc1E9Q6E9 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Simc1E9Q6E9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Simc1E9Q6E9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Simc1E9Q6E9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Simc1E9Q6E9 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Simc1E9Q6E9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Simc1E9Q6E9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Simc1E9Q6E9 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Simc1E9Q6E9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Simc1E9Q6E9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Simc1E9Q6E9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Simc1E9Q6E9 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Simc1E9Q6E9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Simc1E9Q6E9 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Simc1E9Q6E9 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Simc1E9Q6E9 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Simc1E9Q6E9 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Simc1E9Q6E9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Simc1E9Q6E9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Simc1E9Q6E9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Simc1E9Q6E9 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Simc1E9Q6E9 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Simc1E9Q6E9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Simc1E9Q6E9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Simc1E9Q6E9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Simc1E9Q6E9 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Simc1E9Q6E9 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Simc1E9Q6E9 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Simc1E9Q6E9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Simc1E9Q6E9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Simc1E9Q6E9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Simc1E9Q6E9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Simc1E9Q6E9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Simc1E9Q6E9 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Simc1E9Q6E9 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms