Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6B2

Ccdc85c, Coiled-coil domain-containing protein 85C, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85cE9Q6B2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc85cE9Q6B2 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc85cE9Q6B2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc85cE9Q6B2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc85cE9Q6B2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc85cE9Q6B2 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc85cE9Q6B2 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc85cE9Q6B2 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc85cE9Q6B2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc85cE9Q6B2 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc85cE9Q6B2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc85cE9Q6B2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc85cE9Q6B2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc85cE9Q6B2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc85cE9Q6B2 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc85cE9Q6B2 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc85cE9Q6B2 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc85cE9Q6B2 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc85cE9Q6B2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc85cE9Q6B2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc85cE9Q6B2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc85cE9Q6B2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc85cE9Q6B2 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc85cE9Q6B2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc85cE9Q6B2 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc85cE9Q6B2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc85cE9Q6B2 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc85cE9Q6B2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc85cE9Q6B2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc85cE9Q6B2 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc85cE9Q6B2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc85cE9Q6B2 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc85cE9Q6B2 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc85cE9Q6B2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc85cE9Q6B2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc85cE9Q6B2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc85cE9Q6B2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc85cE9Q6B2 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc85cE9Q6B2 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc85cE9Q6B2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc85cE9Q6B2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc85cE9Q6B2 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc85cE9Q6B2 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc85cE9Q6B2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc85cE9Q6B2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc85cE9Q6B2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc85cE9Q6B2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc85cE9Q6B2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc85cE9Q6B2 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc85cE9Q6B2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc85cE9Q6B2 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc85cE9Q6B2 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc85cE9Q6B2 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc85cE9Q6B2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ccdc85cE9Q6B2 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ccdc85cE9Q6B2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc85cE9Q6B2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc85cE9Q6B2 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc85cE9Q6B2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc85cE9Q6B2 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc85cE9Q6B2 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc85cE9Q6B2 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc85cE9Q6B2 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc85cE9Q6B2 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc85cE9Q6B2 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc85cE9Q6B2 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc85cE9Q6B2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc85cE9Q6B2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc85cE9Q6B2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc85cE9Q6B2 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc85cE9Q6B2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc85cE9Q6B2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc85cE9Q6B2 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc85cE9Q6B2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc85cE9Q6B2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc85cE9Q6B2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc85cE9Q6B2 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc85cE9Q6B2 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc85cE9Q6B2 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc85cE9Q6B2 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc85cE9Q6B2 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc85cE9Q6B2 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc85cE9Q6B2 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc85cE9Q6B2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc85cE9Q6B2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc85cE9Q6B2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc85cE9Q6B2 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc85cE9Q6B2 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc85cE9Q6B2 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc85cE9Q6B2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc85cE9Q6B2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc85cE9Q6B2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc85cE9Q6B2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc85cE9Q6B2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc85cE9Q6B2 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc85cE9Q6B2 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc85cE9Q6B2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ccdc85cE9Q6B2 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc85cE9Q6B2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms