Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5Z5

Fancf, Fanconi anemia group F protein, mousemouse

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FancfE9Q5Z5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FancfE9Q5Z5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FancfE9Q5Z5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FancfE9Q5Z5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FancfE9Q5Z5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FancfE9Q5Z5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FancfE9Q5Z5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FancfE9Q5Z5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FancfE9Q5Z5 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FancfE9Q5Z5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FancfE9Q5Z5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
FancfE9Q5Z5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
FancfE9Q5Z5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FancfE9Q5Z5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FancfE9Q5Z5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FancfE9Q5Z5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FancfE9Q5Z5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FancfE9Q5Z5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FancfE9Q5Z5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FancfE9Q5Z5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FancfE9Q5Z5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FancfE9Q5Z5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
FancfE9Q5Z5 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FancfE9Q5Z5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FancfE9Q5Z5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FancfE9Q5Z5 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FancfE9Q5Z5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FancfE9Q5Z5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FancfE9Q5Z5 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FancfE9Q5Z5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FancfE9Q5Z5 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FancfE9Q5Z5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FancfE9Q5Z5 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FancfE9Q5Z5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FancfE9Q5Z5 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FancfE9Q5Z5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FancfE9Q5Z5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FancfE9Q5Z5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FancfE9Q5Z5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FancfE9Q5Z5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FancfE9Q5Z5 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FancfE9Q5Z5 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FancfE9Q5Z5 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FancfE9Q5Z5 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FancfE9Q5Z5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FancfE9Q5Z5 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FancfE9Q5Z5 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FancfE9Q5Z5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FancfE9Q5Z5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FancfE9Q5Z5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FancfE9Q5Z5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FancfE9Q5Z5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FancfE9Q5Z5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FancfE9Q5Z5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FancfE9Q5Z5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FancfE9Q5Z5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FancfE9Q5Z5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FancfE9Q5Z5 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FancfE9Q5Z5 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FancfE9Q5Z5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FancfE9Q5Z5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
FancfE9Q5Z5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FancfE9Q5Z5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FancfE9Q5Z5 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FancfE9Q5Z5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FancfE9Q5Z5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FancfE9Q5Z5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
FancfE9Q5Z5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FancfE9Q5Z5 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FancfE9Q5Z5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FancfE9Q5Z5 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FancfE9Q5Z5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
FancfE9Q5Z5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FancfE9Q5Z5 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FancfE9Q5Z5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FancfE9Q5Z5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FancfE9Q5Z5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FancfE9Q5Z5 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FancfE9Q5Z5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FancfE9Q5Z5 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FancfE9Q5Z5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FancfE9Q5Z5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FancfE9Q5Z5 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FancfE9Q5Z5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FancfE9Q5Z5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FancfE9Q5Z5 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FancfE9Q5Z5 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FancfE9Q5Z5 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
FancfE9Q5Z5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FancfE9Q5Z5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FancfE9Q5Z5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FancfE9Q5Z5 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FancfE9Q5Z5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FancfE9Q5Z5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FancfE9Q5Z5 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FancfE9Q5Z5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FancfE9Q5Z5 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FancfE9Q5Z5 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FancfE9Q5Z5 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FancfE9Q5Z5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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