Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3H4

Susd1, Sushi domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 752 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd1E9Q3H4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Susd1E9Q3H4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Susd1E9Q3H4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Susd1E9Q3H4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Susd1E9Q3H4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Susd1E9Q3H4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Susd1E9Q3H4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Susd1E9Q3H4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Susd1E9Q3H4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Susd1E9Q3H4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Susd1E9Q3H4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Susd1E9Q3H4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Susd1E9Q3H4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Susd1E9Q3H4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Susd1E9Q3H4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Susd1E9Q3H4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Susd1E9Q3H4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Susd1E9Q3H4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Susd1E9Q3H4 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Susd1E9Q3H4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Susd1E9Q3H4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Susd1E9Q3H4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Susd1E9Q3H4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Susd1E9Q3H4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Susd1E9Q3H4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Susd1E9Q3H4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Susd1E9Q3H4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Susd1E9Q3H4 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Susd1E9Q3H4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Susd1E9Q3H4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Susd1E9Q3H4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Susd1E9Q3H4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Susd1E9Q3H4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Susd1E9Q3H4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Susd1E9Q3H4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Susd1E9Q3H4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Susd1E9Q3H4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Susd1E9Q3H4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Susd1E9Q3H4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Susd1E9Q3H4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Susd1E9Q3H4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Susd1E9Q3H4 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Susd1E9Q3H4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Susd1E9Q3H4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Susd1E9Q3H4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Susd1E9Q3H4 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Susd1E9Q3H4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Susd1E9Q3H4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Susd1E9Q3H4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Susd1E9Q3H4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Susd1E9Q3H4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Susd1E9Q3H4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Susd1E9Q3H4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Susd1E9Q3H4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Susd1E9Q3H4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Susd1E9Q3H4 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Susd1E9Q3H4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Susd1E9Q3H4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Susd1E9Q3H4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Susd1E9Q3H4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Susd1E9Q3H4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Susd1E9Q3H4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Susd1E9Q3H4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Susd1E9Q3H4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Susd1E9Q3H4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Susd1E9Q3H4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Susd1E9Q3H4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Susd1E9Q3H4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Susd1E9Q3H4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Susd1E9Q3H4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Susd1E9Q3H4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Susd1E9Q3H4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Susd1E9Q3H4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Susd1E9Q3H4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Susd1E9Q3H4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Susd1E9Q3H4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Susd1E9Q3H4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Susd1E9Q3H4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Susd1E9Q3H4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Susd1E9Q3H4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Susd1E9Q3H4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Susd1E9Q3H4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Susd1E9Q3H4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Susd1E9Q3H4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Susd1E9Q3H4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Susd1E9Q3H4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Susd1E9Q3H4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Susd1E9Q3H4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Susd1E9Q3H4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Susd1E9Q3H4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Susd1E9Q3H4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Susd1E9Q3H4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Susd1E9Q3H4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Susd1E9Q3H4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Susd1E9Q3H4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Susd1E9Q3H4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Susd1E9Q3H4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Susd1E9Q3H4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Susd1E9Q3H4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Susd1E9Q3H4 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms