Protein–RNA interactions for Protein: E9Q368

Tarbp1, TAR RNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp1E9Q368 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Tarbp1E9Q368 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Tarbp1E9Q368 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Tarbp1E9Q368 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Tarbp1E9Q368 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Tarbp1E9Q368 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Tarbp1E9Q368 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Tarbp1E9Q368 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Tarbp1E9Q368 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Tarbp1E9Q368 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Tarbp1E9Q368 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Tarbp1E9Q368 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Tarbp1E9Q368 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Tarbp1E9Q368 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Tarbp1E9Q368 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Tarbp1E9Q368 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Tarbp1E9Q368 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Tarbp1E9Q368 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Tarbp1E9Q368 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Tarbp1E9Q368 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Tarbp1E9Q368 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Tarbp1E9Q368 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Tarbp1E9Q368 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Tarbp1E9Q368 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Tarbp1E9Q368 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Tarbp1E9Q368 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Tarbp1E9Q368 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Tarbp1E9Q368 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Tarbp1E9Q368 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Tarbp1E9Q368 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Tarbp1E9Q368 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Tarbp1E9Q368 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Tarbp1E9Q368 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Tarbp1E9Q368 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Tarbp1E9Q368 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
Tarbp1E9Q368 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Tarbp1E9Q368 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Tarbp1E9Q368 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Tarbp1E9Q368 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Tarbp1E9Q368 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Tarbp1E9Q368 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Tarbp1E9Q368 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Tarbp1E9Q368 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Tarbp1E9Q368 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Tarbp1E9Q368 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Tarbp1E9Q368 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Tarbp1E9Q368 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Tarbp1E9Q368 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Tarbp1E9Q368 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Tarbp1E9Q368 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Tarbp1E9Q368 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Tarbp1E9Q368 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Tarbp1E9Q368 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Tarbp1E9Q368 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Tarbp1E9Q368 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Tarbp1E9Q368 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Tarbp1E9Q368 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Tarbp1E9Q368 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Tarbp1E9Q368 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Tarbp1E9Q368 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Tarbp1E9Q368 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Tarbp1E9Q368 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Tarbp1E9Q368 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Tarbp1E9Q368 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Tarbp1E9Q368 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Tarbp1E9Q368 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Tarbp1E9Q368 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Tarbp1E9Q368 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Tarbp1E9Q368 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Tarbp1E9Q368 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Tarbp1E9Q368 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Tarbp1E9Q368 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Tarbp1E9Q368 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Tarbp1E9Q368 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Tarbp1E9Q368 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Tarbp1E9Q368 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Tarbp1E9Q368 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Tarbp1E9Q368 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Tarbp1E9Q368 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Tarbp1E9Q368 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Tarbp1E9Q368 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Tarbp1E9Q368 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Tarbp1E9Q368 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Tarbp1E9Q368 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Tarbp1E9Q368 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Tarbp1E9Q368 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Tarbp1E9Q368 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Tarbp1E9Q368 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Tarbp1E9Q368 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Tarbp1E9Q368 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Tarbp1E9Q368 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Tarbp1E9Q368 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Tarbp1E9Q368 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Tarbp1E9Q368 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Tarbp1E9Q368 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Tarbp1E9Q368 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Tarbp1E9Q368 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Tarbp1E9Q368 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Tarbp1E9Q368 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Tarbp1E9Q368 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms