Protein–RNA interactions for Protein: E9PXF3

Gm5415, Predicted gene 5415, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5415E9PXF3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm5415E9PXF3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm5415E9PXF3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm5415E9PXF3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm5415E9PXF3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm5415E9PXF3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm5415E9PXF3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm5415E9PXF3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm5415E9PXF3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm5415E9PXF3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm5415E9PXF3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm5415E9PXF3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm5415E9PXF3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm5415E9PXF3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm5415E9PXF3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm5415E9PXF3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm5415E9PXF3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm5415E9PXF3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm5415E9PXF3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm5415E9PXF3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm5415E9PXF3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm5415E9PXF3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm5415E9PXF3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm5415E9PXF3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm5415E9PXF3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm5415E9PXF3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm5415E9PXF3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm5415E9PXF3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm5415E9PXF3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm5415E9PXF3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm5415E9PXF3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm5415E9PXF3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm5415E9PXF3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm5415E9PXF3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm5415E9PXF3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm5415E9PXF3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm5415E9PXF3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm5415E9PXF3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm5415E9PXF3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm5415E9PXF3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm5415E9PXF3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm5415E9PXF3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm5415E9PXF3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm5415E9PXF3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm5415E9PXF3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm5415E9PXF3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm5415E9PXF3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm5415E9PXF3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm5415E9PXF3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm5415E9PXF3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm5415E9PXF3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm5415E9PXF3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm5415E9PXF3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm5415E9PXF3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm5415E9PXF3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm5415E9PXF3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm5415E9PXF3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm5415E9PXF3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm5415E9PXF3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm5415E9PXF3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm5415E9PXF3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm5415E9PXF3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm5415E9PXF3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm5415E9PXF3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm5415E9PXF3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm5415E9PXF3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm5415E9PXF3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm5415E9PXF3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm5415E9PXF3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm5415E9PXF3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm5415E9PXF3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm5415E9PXF3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm5415E9PXF3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm5415E9PXF3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm5415E9PXF3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm5415E9PXF3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm5415E9PXF3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm5415E9PXF3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm5415E9PXF3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm5415E9PXF3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm5415E9PXF3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm5415E9PXF3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm5415E9PXF3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm5415E9PXF3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm5415E9PXF3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gm5415E9PXF3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gm5415E9PXF3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gm5415E9PXF3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm5415E9PXF3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm5415E9PXF3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm5415E9PXF3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm5415E9PXF3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm5415E9PXF3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm5415E9PXF3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm5415E9PXF3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm5415E9PXF3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm5415E9PXF3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm5415E9PXF3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm5415E9PXF3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm5415E9PXF3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms