Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Srp54bE9PXC0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Srp54bE9PXC0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Srp54bE9PXC0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Srp54bE9PXC0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Srp54bE9PXC0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Srp54bE9PXC0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Srp54bE9PXC0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Srp54bE9PXC0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Srp54bE9PXC0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Srp54bE9PXC0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Srp54bE9PXC0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Srp54bE9PXC0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Srp54bE9PXC0 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Srp54bE9PXC0 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Srp54bE9PXC0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Srp54bE9PXC0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Srp54bE9PXC0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Srp54bE9PXC0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Srp54bE9PXC0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Srp54bE9PXC0 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Srp54bE9PXC0 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Srp54bE9PXC0 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Srp54bE9PXC0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Srp54bE9PXC0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Srp54bE9PXC0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Srp54bE9PXC0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Srp54bE9PXC0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Srp54bE9PXC0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Srp54bE9PXC0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Srp54bE9PXC0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Srp54bE9PXC0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Srp54bE9PXC0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Srp54bE9PXC0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Srp54bE9PXC0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Srp54bE9PXC0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Srp54bE9PXC0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Srp54bE9PXC0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Srp54bE9PXC0 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Srp54bE9PXC0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Srp54bE9PXC0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Srp54bE9PXC0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Srp54bE9PXC0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Srp54bE9PXC0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Srp54bE9PXC0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Srp54bE9PXC0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Srp54bE9PXC0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Srp54bE9PXC0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Srp54bE9PXC0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Srp54bE9PXC0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Srp54bE9PXC0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Srp54bE9PXC0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Srp54bE9PXC0 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Srp54bE9PXC0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Srp54bE9PXC0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Srp54bE9PXC0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Srp54bE9PXC0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Srp54bE9PXC0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Srp54bE9PXC0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Srp54bE9PXC0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Srp54bE9PXC0 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Srp54bE9PXC0 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Srp54bE9PXC0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Srp54bE9PXC0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Srp54bE9PXC0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Srp54bE9PXC0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Srp54bE9PXC0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Srp54bE9PXC0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Srp54bE9PXC0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Srp54bE9PXC0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Srp54bE9PXC0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Srp54bE9PXC0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Srp54bE9PXC0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Srp54bE9PXC0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Srp54bE9PXC0 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Srp54bE9PXC0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Srp54bE9PXC0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Srp54bE9PXC0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Srp54bE9PXC0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Srp54bE9PXC0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Srp54bE9PXC0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Srp54bE9PXC0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Srp54bE9PXC0 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Srp54bE9PXC0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Srp54bE9PXC0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Srp54bE9PXC0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Srp54bE9PXC0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Srp54bE9PXC0 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Srp54bE9PXC0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Srp54bE9PXC0 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Srp54bE9PXC0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Srp54bE9PXC0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Srp54bE9PXC0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Srp54bE9PXC0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Srp54bE9PXC0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Srp54bE9PXC0 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Srp54bE9PXC0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Srp54bE9PXC0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Srp54bE9PXC0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Srp54bE9PXC0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms