Protein–RNA interactions for Protein: E9PVL6

Trim30b, Tripartite motif-containing 30B, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30bE9PVL6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trim30bE9PVL6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim30bE9PVL6 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim30bE9PVL6 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim30bE9PVL6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim30bE9PVL6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim30bE9PVL6 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim30bE9PVL6 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim30bE9PVL6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim30bE9PVL6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim30bE9PVL6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim30bE9PVL6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim30bE9PVL6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim30bE9PVL6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim30bE9PVL6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim30bE9PVL6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim30bE9PVL6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim30bE9PVL6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim30bE9PVL6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim30bE9PVL6 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim30bE9PVL6 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim30bE9PVL6 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim30bE9PVL6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim30bE9PVL6 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim30bE9PVL6 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim30bE9PVL6 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim30bE9PVL6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim30bE9PVL6 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim30bE9PVL6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim30bE9PVL6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim30bE9PVL6 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim30bE9PVL6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim30bE9PVL6 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim30bE9PVL6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim30bE9PVL6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim30bE9PVL6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim30bE9PVL6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim30bE9PVL6 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim30bE9PVL6 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim30bE9PVL6 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim30bE9PVL6 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim30bE9PVL6 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim30bE9PVL6 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim30bE9PVL6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim30bE9PVL6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim30bE9PVL6 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim30bE9PVL6 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim30bE9PVL6 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim30bE9PVL6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim30bE9PVL6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim30bE9PVL6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim30bE9PVL6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim30bE9PVL6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim30bE9PVL6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim30bE9PVL6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim30bE9PVL6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim30bE9PVL6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim30bE9PVL6 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim30bE9PVL6 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim30bE9PVL6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim30bE9PVL6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim30bE9PVL6 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trim30bE9PVL6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trim30bE9PVL6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim30bE9PVL6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim30bE9PVL6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim30bE9PVL6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim30bE9PVL6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim30bE9PVL6 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim30bE9PVL6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim30bE9PVL6 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim30bE9PVL6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim30bE9PVL6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim30bE9PVL6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim30bE9PVL6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim30bE9PVL6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim30bE9PVL6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim30bE9PVL6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim30bE9PVL6 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim30bE9PVL6 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim30bE9PVL6 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim30bE9PVL6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim30bE9PVL6 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim30bE9PVL6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim30bE9PVL6 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim30bE9PVL6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim30bE9PVL6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim30bE9PVL6 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim30bE9PVL6 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim30bE9PVL6 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim30bE9PVL6 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim30bE9PVL6 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim30bE9PVL6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim30bE9PVL6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim30bE9PVL6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim30bE9PVL6 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim30bE9PVL6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim30bE9PVL6 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim30bE9PVL6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim30bE9PVL6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms