Protein–RNA interactions for Protein: E2JF22

Piezo1, Piezo-type mechanosensitive ion channel component 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Piezo1E2JF22 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Piezo1E2JF22 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Piezo1E2JF22 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Piezo1E2JF22 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Piezo1E2JF22 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Piezo1E2JF22 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Piezo1E2JF22 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Piezo1E2JF22 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Piezo1E2JF22 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Piezo1E2JF22 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Piezo1E2JF22 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Piezo1E2JF22 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Piezo1E2JF22 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Piezo1E2JF22 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Piezo1E2JF22 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Piezo1E2JF22 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Piezo1E2JF22 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Piezo1E2JF22 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Piezo1E2JF22 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Piezo1E2JF22 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Piezo1E2JF22 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Piezo1E2JF22 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Piezo1E2JF22 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Piezo1E2JF22 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Piezo1E2JF22 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Piezo1E2JF22 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Piezo1E2JF22 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Piezo1E2JF22 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Piezo1E2JF22 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Piezo1E2JF22 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Piezo1E2JF22 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Piezo1E2JF22 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Piezo1E2JF22 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Piezo1E2JF22 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Piezo1E2JF22 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Piezo1E2JF22 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Piezo1E2JF22 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Piezo1E2JF22 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Piezo1E2JF22 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Piezo1E2JF22 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Piezo1E2JF22 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Piezo1E2JF22 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Piezo1E2JF22 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Piezo1E2JF22 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Piezo1E2JF22 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Piezo1E2JF22 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Piezo1E2JF22 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Piezo1E2JF22 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Piezo1E2JF22 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Piezo1E2JF22 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Piezo1E2JF22 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Piezo1E2JF22 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.28■■□□□ 1
Piezo1E2JF22 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Piezo1E2JF22 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Piezo1E2JF22 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Piezo1E2JF22 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Piezo1E2JF22 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Piezo1E2JF22 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Piezo1E2JF22 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Piezo1E2JF22 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Piezo1E2JF22 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Piezo1E2JF22 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Piezo1E2JF22 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Piezo1E2JF22 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Piezo1E2JF22 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Piezo1E2JF22 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Piezo1E2JF22 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Piezo1E2JF22 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Piezo1E2JF22 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Piezo1E2JF22 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Piezo1E2JF22 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Piezo1E2JF22 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Piezo1E2JF22 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Piezo1E2JF22 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Piezo1E2JF22 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Piezo1E2JF22 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Piezo1E2JF22 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Piezo1E2JF22 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Piezo1E2JF22 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Piezo1E2JF22 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Piezo1E2JF22 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Piezo1E2JF22 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Piezo1E2JF22 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Piezo1E2JF22 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Piezo1E2JF22 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Piezo1E2JF22 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Piezo1E2JF22 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Piezo1E2JF22 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Piezo1E2JF22 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Piezo1E2JF22 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Piezo1E2JF22 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Piezo1E2JF22 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Piezo1E2JF22 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Piezo1E2JF22 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Piezo1E2JF22 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Piezo1E2JF22 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Piezo1E2JF22 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Piezo1E2JF22 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Piezo1E2JF22 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Piezo1E2JF22 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms