Protein–RNA interactions for Protein: E0CZ16

Klhl3, Kelch-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl3E0CZ16 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Klhl3E0CZ16 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Klhl3E0CZ16 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Klhl3E0CZ16 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Klhl3E0CZ16 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Klhl3E0CZ16 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Klhl3E0CZ16 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Klhl3E0CZ16 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Klhl3E0CZ16 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Klhl3E0CZ16 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Klhl3E0CZ16 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Klhl3E0CZ16 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Klhl3E0CZ16 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Klhl3E0CZ16 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Klhl3E0CZ16 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Klhl3E0CZ16 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Klhl3E0CZ16 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Klhl3E0CZ16 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Klhl3E0CZ16 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Klhl3E0CZ16 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Klhl3E0CZ16 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Klhl3E0CZ16 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Klhl3E0CZ16 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Klhl3E0CZ16 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Klhl3E0CZ16 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Klhl3E0CZ16 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Klhl3E0CZ16 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Klhl3E0CZ16 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Klhl3E0CZ16 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Klhl3E0CZ16 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Klhl3E0CZ16 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Klhl3E0CZ16 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Klhl3E0CZ16 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Klhl3E0CZ16 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Klhl3E0CZ16 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Klhl3E0CZ16 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Klhl3E0CZ16 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Klhl3E0CZ16 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Klhl3E0CZ16 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Klhl3E0CZ16 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Klhl3E0CZ16 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Klhl3E0CZ16 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Klhl3E0CZ16 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Klhl3E0CZ16 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Klhl3E0CZ16 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Klhl3E0CZ16 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Klhl3E0CZ16 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Klhl3E0CZ16 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Klhl3E0CZ16 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Klhl3E0CZ16 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Klhl3E0CZ16 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Klhl3E0CZ16 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Klhl3E0CZ16 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Klhl3E0CZ16 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Klhl3E0CZ16 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Klhl3E0CZ16 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Klhl3E0CZ16 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Klhl3E0CZ16 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Klhl3E0CZ16 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Klhl3E0CZ16 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Klhl3E0CZ16 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Klhl3E0CZ16 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Klhl3E0CZ16 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Klhl3E0CZ16 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Klhl3E0CZ16 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Klhl3E0CZ16 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Klhl3E0CZ16 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Klhl3E0CZ16 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Klhl3E0CZ16 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Klhl3E0CZ16 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Klhl3E0CZ16 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Klhl3E0CZ16 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Klhl3E0CZ16 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Klhl3E0CZ16 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Klhl3E0CZ16 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Klhl3E0CZ16 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Klhl3E0CZ16 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Klhl3E0CZ16 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Klhl3E0CZ16 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Klhl3E0CZ16 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Klhl3E0CZ16 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Klhl3E0CZ16 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Klhl3E0CZ16 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Klhl3E0CZ16 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Klhl3E0CZ16 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Klhl3E0CZ16 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Klhl3E0CZ16 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Klhl3E0CZ16 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Klhl3E0CZ16 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Klhl3E0CZ16 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Klhl3E0CZ16 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Klhl3E0CZ16 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Klhl3E0CZ16 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Klhl3E0CZ16 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Klhl3E0CZ16 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Klhl3E0CZ16 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Klhl3E0CZ16 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Klhl3E0CZ16 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Klhl3E0CZ16 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Klhl3E0CZ16 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms