Protein–RNA interactions for Protein: E0CXC6

4930558K02Rik, RIKEN cDNA 4930558K02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930558K02RikE0CXC6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
4930558K02RikE0CXC6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4930558K02RikE0CXC6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
4930558K02RikE0CXC6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4930558K02RikE0CXC6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4930558K02RikE0CXC6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4930558K02RikE0CXC6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4930558K02RikE0CXC6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4930558K02RikE0CXC6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
4930558K02RikE0CXC6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
4930558K02RikE0CXC6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
4930558K02RikE0CXC6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4930558K02RikE0CXC6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
4930558K02RikE0CXC6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4930558K02RikE0CXC6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4930558K02RikE0CXC6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4930558K02RikE0CXC6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930558K02RikE0CXC6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930558K02RikE0CXC6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930558K02RikE0CXC6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930558K02RikE0CXC6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
4930558K02RikE0CXC6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930558K02RikE0CXC6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930558K02RikE0CXC6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4930558K02RikE0CXC6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
4930558K02RikE0CXC6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4930558K02RikE0CXC6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4930558K02RikE0CXC6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4930558K02RikE0CXC6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4930558K02RikE0CXC6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
4930558K02RikE0CXC6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
4930558K02RikE0CXC6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
4930558K02RikE0CXC6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
4930558K02RikE0CXC6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
4930558K02RikE0CXC6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
4930558K02RikE0CXC6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
4930558K02RikE0CXC6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
4930558K02RikE0CXC6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
4930558K02RikE0CXC6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
4930558K02RikE0CXC6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
4930558K02RikE0CXC6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
4930558K02RikE0CXC6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
4930558K02RikE0CXC6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
4930558K02RikE0CXC6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
4930558K02RikE0CXC6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
4930558K02RikE0CXC6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
4930558K02RikE0CXC6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
4930558K02RikE0CXC6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
4930558K02RikE0CXC6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
4930558K02RikE0CXC6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
4930558K02RikE0CXC6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
4930558K02RikE0CXC6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
4930558K02RikE0CXC6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
4930558K02RikE0CXC6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
4930558K02RikE0CXC6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
4930558K02RikE0CXC6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
4930558K02RikE0CXC6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
4930558K02RikE0CXC6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
4930558K02RikE0CXC6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
4930558K02RikE0CXC6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
4930558K02RikE0CXC6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
4930558K02RikE0CXC6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
4930558K02RikE0CXC6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
4930558K02RikE0CXC6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
4930558K02RikE0CXC6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
4930558K02RikE0CXC6 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
4930558K02RikE0CXC6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
4930558K02RikE0CXC6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
4930558K02RikE0CXC6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
4930558K02RikE0CXC6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
4930558K02RikE0CXC6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
4930558K02RikE0CXC6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
4930558K02RikE0CXC6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
4930558K02RikE0CXC6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
4930558K02RikE0CXC6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
4930558K02RikE0CXC6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
4930558K02RikE0CXC6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
4930558K02RikE0CXC6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
4930558K02RikE0CXC6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
4930558K02RikE0CXC6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
4930558K02RikE0CXC6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
4930558K02RikE0CXC6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
4930558K02RikE0CXC6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
4930558K02RikE0CXC6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
4930558K02RikE0CXC6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
4930558K02RikE0CXC6 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
4930558K02RikE0CXC6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
4930558K02RikE0CXC6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
4930558K02RikE0CXC6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
4930558K02RikE0CXC6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
4930558K02RikE0CXC6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
4930558K02RikE0CXC6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
4930558K02RikE0CXC6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
4930558K02RikE0CXC6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
4930558K02RikE0CXC6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
4930558K02RikE0CXC6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
4930558K02RikE0CXC6 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
4930558K02RikE0CXC6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
4930558K02RikE0CXC6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
4930558K02RikE0CXC6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms