Protein–RNA interactions for Protein: D3Z741

4930444G20Rik, RIKEN cDNA 4930444G20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930444G20RikD3Z741 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4930444G20RikD3Z741 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4930444G20RikD3Z741 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
4930444G20RikD3Z741 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
4930444G20RikD3Z741 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
4930444G20RikD3Z741 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
4930444G20RikD3Z741 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
4930444G20RikD3Z741 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
4930444G20RikD3Z741 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
4930444G20RikD3Z741 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
4930444G20RikD3Z741 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
4930444G20RikD3Z741 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
4930444G20RikD3Z741 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4930444G20RikD3Z741 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
4930444G20RikD3Z741 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4930444G20RikD3Z741 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4930444G20RikD3Z741 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4930444G20RikD3Z741 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
4930444G20RikD3Z741 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
4930444G20RikD3Z741 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
4930444G20RikD3Z741 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4930444G20RikD3Z741 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4930444G20RikD3Z741 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4930444G20RikD3Z741 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4930444G20RikD3Z741 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4930444G20RikD3Z741 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4930444G20RikD3Z741 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
4930444G20RikD3Z741 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
4930444G20RikD3Z741 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
4930444G20RikD3Z741 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
4930444G20RikD3Z741 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
4930444G20RikD3Z741 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4930444G20RikD3Z741 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
4930444G20RikD3Z741 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4930444G20RikD3Z741 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4930444G20RikD3Z741 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4930444G20RikD3Z741 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
4930444G20RikD3Z741 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
4930444G20RikD3Z741 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
4930444G20RikD3Z741 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4930444G20RikD3Z741 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4930444G20RikD3Z741 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4930444G20RikD3Z741 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4930444G20RikD3Z741 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4930444G20RikD3Z741 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
4930444G20RikD3Z741 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
4930444G20RikD3Z741 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4930444G20RikD3Z741 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4930444G20RikD3Z741 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4930444G20RikD3Z741 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4930444G20RikD3Z741 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4930444G20RikD3Z741 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4930444G20RikD3Z741 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
4930444G20RikD3Z741 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
4930444G20RikD3Z741 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
4930444G20RikD3Z741 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4930444G20RikD3Z741 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
4930444G20RikD3Z741 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4930444G20RikD3Z741 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4930444G20RikD3Z741 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4930444G20RikD3Z741 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
4930444G20RikD3Z741 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
4930444G20RikD3Z741 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4930444G20RikD3Z741 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4930444G20RikD3Z741 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
4930444G20RikD3Z741 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4930444G20RikD3Z741 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4930444G20RikD3Z741 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
4930444G20RikD3Z741 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
4930444G20RikD3Z741 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
4930444G20RikD3Z741 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
4930444G20RikD3Z741 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
4930444G20RikD3Z741 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
4930444G20RikD3Z741 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
4930444G20RikD3Z741 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4930444G20RikD3Z741 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
4930444G20RikD3Z741 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
4930444G20RikD3Z741 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4930444G20RikD3Z741 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
4930444G20RikD3Z741 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
4930444G20RikD3Z741 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4930444G20RikD3Z741 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4930444G20RikD3Z741 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
4930444G20RikD3Z741 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4930444G20RikD3Z741 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4930444G20RikD3Z741 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4930444G20RikD3Z741 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
4930444G20RikD3Z741 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4930444G20RikD3Z741 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4930444G20RikD3Z741 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4930444G20RikD3Z741 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4930444G20RikD3Z741 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
4930444G20RikD3Z741 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
4930444G20RikD3Z741 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4930444G20RikD3Z741 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
4930444G20RikD3Z741 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4930444G20RikD3Z741 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
4930444G20RikD3Z741 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
4930444G20RikD3Z741 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4930444G20RikD3Z741 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms